Bonjour tout le monde !
Je réalise de la quantification relative avec la méthode du Delta/DeltaCt. Au labo j'ai un light cycler 32 capillaires.
Mes conditions d'amplification (MgCl2, [] amorces et T°C annealing) sont différentes pour mon gène cible et mon gène de référence.
Pour chaque gène à amplifier, j'ai un très grand nombre d'échantillons > 32, du coup il me faudra faire 2 runs indépendants pour passer l'ensemble de mes échantillons pour un gène.
Ma question est peut-être naïve mais faut il que je dépose mon réplicat du calibrateur dans le deuxième run de mes échantillons tests ?
Comment feriez-vous pour le second run ?
H2O, calibrateur, restant des échantillons cibles
ou
H2O, restant des échantillons cibles
Merci beaucoup par avance !
N.B: j'utilise du SyBr Green.
-----