[Biologie Moléculaire] manipulation de sequences
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manipulation de sequences



  1. #1
    inviteb3f8260a

    manipulation de sequences


    ------

    Bonjour,


    J'ai une centaine de séquences au format fasta dans un fichier unique. Je souhaite rajouter une vingtaine d'autres séquences, venant d'une autre source, et ne correspondant qu'à une partie des premières.

    Pouvez vous me conseiller un outil qui me permettrait facilement d'homogénéiser les tailles des séquences (c'est à dire de ne garder que les nucléotides n1 à n2 de ma première centaine de séquence) ?

    J'utilise habituellement Bioedit et cela n'est pas possible sur ce logiciel.
    Merci

    -----

  2. #2
    jugen

    Re : manipulation de sequences

    Moi je vois bien un petit programme en langage Perl (bien entendu si tu sais programmer dans ce langage autrement ce sera plus rapide de le faire à la main) mais je ne connais aucun logiciel qui pourrait le faire pour toi désolé.

  3. #3
    inviteb3f8260a

    Re : manipulation de sequences

    Merci pour l'info mais effectivement la programmation me semble plus compliqué à faire que le faire sequence par sequence.
    bonne journée
    Eric

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