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Gammes pour calcul de l'éfficacité de la RT-qPCR



  1. #1
    mush_

    Gammes pour calcul de l'éfficacité de la RT-qPCR

    Bonjour,

    j'ai une doute pour la réalisation d'un travail sur la qPCR.

    dans le labo je fait mes calculs de quantité relative sans le calcul de l'efficacité, cet-à-dire, j'utilise E=2 (efficacité = 100%), mais si je veux faire ces calculs de la quantité relative avec la vrai éfficacité ( E differente de 2), je peux utiliser la même formule R=E^-deltaCp sauf que en se cas le E est differente de 2.
    ma question est comme est calculé cette éfficacité?
    je dois faire une gamme de les échantillons ou du gène de ménage?
    c'est l'efficacité de la gamme de l'echantillons ou l'éfficacité de la gamme du gène de mènage?


    merci
    (et pardon pour les erreurs de français: je suis une étudiante étrangère)

    -----


  2. #2
    Flyingbike

    Re : Gammes pour calcul de l'éfficacité de la RT-qPCR

    L'efficacité est propre a un protocole donné, c'est à dire amorces, mix réactionnel et programme d'amplification. La seule façon de calculer l'efficacité d'une PCR est de faire une gamme de concentration en parallèle des échantillons pour chaque couple d'amorces utilisé. Il faut ensuite calculer la pente de la droite log(concentration) = f(Ct) qui est liée a l'efficacité.

  3. #3
    mush_

    Re : Gammes pour calcul de l'éfficacité de la RT-qPCR

    Merci beaucoup.

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