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Début de la région 5'UTR



  1. #1
    Madmoizel

    Début de la région 5'UTR

    Bonjour,

    Est-ce que qqun pourrait m'expliquer pourquoi on ne connait pas exactement le début de la région 5'UTR des gènes (en tout cas pour Arabidopsis)? On m'a dit que le début de la région 5'UTR était estimée sur base de la fin de la région 3'UTR (qui est connue grâce aux sites de polyadénylation) et de la taille des transcrits.
    A partir du moment où on peut séquencer l'entièreté des cDNA, on devrait connaitre la position exacte de la région 5'UTR, non?

    Merci d'avance!!

    -----


  2. #2
    Biob

    Re : Début de la région 5'UTR

    Citation Envoyé par Madmoizel Voir le message
    Bonjour,

    Est-ce que qqun pourrait m'expliquer pourquoi on ne connait pas exactement le début de la région 5'UTR des gènes (en tout cas pour Arabidopsis)? On m'a dit que le début de la région 5'UTR était estimée sur base de la fin de la région 3'UTR (qui est connue grâce aux sites de polyadénylation) et de la taille des transcrits.
    A partir du moment où on peut séquencer l'entièreté des cDNA, on devrait connaitre la position exacte de la région 5'UTR, non?

    Merci d'avance!!
    Sur une molécule d'ARNm, la région 5' UTR (untraslated region=région non traduite) est la région qui se trouve juste en amont "avant" du codon "start" (codon du début de la traduction). Si on arrive à isoler l'ARNm d'un gène, on peut alors connaitre la région 5' UTR par séquençage (de l'ADNc). Le début de cette région n'est pas précis parce qu'il y a des séquences régulatrices plus ou moins éloignées du codon start. Il faut des études expérimentales (délétion de séquences, substitutions de bases...etc) pour déterminer le début de cette région.

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