Séquence d'un gène

[rayhana-b21]

Bonjour

Comment peut on ressortir une séquence de cDNA d'un gène donné ??
Quelqu'un connait des sites pour le faire ??

Merci d'avance
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[Flyingbike]

Ca dépendra de l'oreganisme.

Si tu cherches la séquence d'un gène connu d'un organisme courant, il y a des chances de le trouver ici :http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore

[rayhana-b21]

ça n'a pas marché je cherche la séquence d'un isoforme du gène VEGF humain, c'est un peu délicat...

[Flyingbike]

ca doit être un problème de méthode :

A droite de la page, on peut restreindre a l'organisme (Homo sapiens) et au type de séquence recherché (mRNA en l'occurrence)

On peut avoir plus de précisions ?
En essayant j'ai trouvé pas mal de choses

[A voir en vidéo sur Futura]

[rayhana-b21]

Merci Flyingbik pour ton aide

En fait c'est l'isoforme 165a du gène VEGF humain dans cette page ils citent des mRNA variants (5 6 7 8 9) et ils ne précisent pas ils référent à quoi j'ai peur de se tremper de gène pourquoi ils n'utilisent pas les mots connus dans la littérature !!!
J'ai pas réussis à extraire la séquence cDNA de cet isoforme c'est bizarre

[Flyingbike]

En effet la nomenclature semble différente. Et encore différente dans les protéines puisqu'ils les appellent variant h,r, q etc...

[Flyingbike]

me demande pas comment mais j'ai trouvé ça : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/19909064

[rayhana-b21]

Géniale !! c'est ce que je cherche enfin...

Merciiiiiiiiiiiiii Flyingbike

[Flyingbike]

Ravi d'avoir aidé

A bientôt