Est-il possible de réaliser le séquençage des acides aminés impliqués dans des interactions

[invite03b083b4]

Bonjour,
Je suis en troisieme année de biochimie, j'ai effectué un TP dans lequel il fallait déterminer les fragments d'interaction d'une protéine avec l'héparine apres
hydrolyse enzymatique de la protéine puis par chromatographie d'affinité et analyser en chromatographie en HPLC.

J'ai pût en conclure par analyse des chromatogrammes qu'il s'agissait de la partie C-terminal de la protéine qui pouvait interagir avec l'héparine
Cependant, je voudrais ajouter une ouverture dans mon compte rendu.

Je voulais savoir si il était possible de séquencer les acides aminés de la protéine qui peuvent interagir avec l'héparine .......

Merci
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[Flyingbike]

on pourrait, mais il y a plus simple.

On pourrait récupérer cette fraction, la caractériser par spectro de masse, et, connaissant la séquence de la protéine et donc les sites de coupure enzymatiques, déterminer la séquence du fragment en question.

Tout ça suppose bien sur qu'on connaisse la protéine testée.