bioinformatique blastx, Pfam

[invite31eac219]

bonjour,

Lors d'un TP de bioinformatique, j'ai utilisé blastx pour déterminer les fonctions de genes ( a partir des ORF identifiées par Artemis), puis j'ai utilisé Pfam.

Mais je ne vois pas trop a quoi correspond le programme Pfam ?

J'ai remarqué qu'on a beaucoup plus de résultats avec blastx qu'avec Pfam, a quoi cela est il du ?

Merci
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[Edelweiss68]

Bonjour,

Pfam est une banque de données répertoriant des familles de protéines identifiées par domaines protéiques. Elle permet de repérer des domaines communs présageant de probables fonctions communes et d'une appartenance à la même famille protéique.

[piwi]

Bonjour,

Je ne vois pas vraiment comment vous êtes parvenu à faire une étude de fonction protéique par blastx. Le raccourci est un peu brutal ^_^

Cordialement,
piwi