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Compréhension cours - Interactions Protéines-Ligands



  1. #1
    Great.J

    Compréhension cours - Interactions Protéines-Ligands

    Bonjour à tous !

    Voila, je suis étudiant en L3 Microbiologie et nous faisons en Biochimie un cours sur les interactions protéines-ligands.
    Je suis très nul lorsqu'il est question d'analyser des courbes ou encore d'identifier des paramètres tels que "KD", "KDapp" ou autre subtilité du genre dans des formules.

    Le problème est que les contrôles terminaux arrivent à grand pas et qu'aucune aide est disponible sur Internet (exceptés les aides en anglais et les aides de profs qui embrouillent la tête plus qu'autre chose).

    Désolé de ma lourde question mais est-ce que quelqu'un qui s'y connait pourrait m'expliquer:
    - la différence entre le KD et le KDapparent
    - la représentation Scatchard
    - la représentation de Hill
    - ce que l'on doit faire lorsqu'on a devant soi une courbe à l'allure hyperbolique,
    Dans le cas du modèle : 1 protéine avec 1 seul site de fixation pour le(s) ligand(s).

    ---
    vu en cours (1 site sur la protéine uniquement)
    - [PL]eq = [Pt].[L]eq/([L]eq+KD) avec [Pt] protéines totales, [Pl] protéines libres, [PL] complexe protéine-ligand, [L] ligand total ...
    - KD = [P]eq.[L]eq/[PL]eq
    - fonction hyperbolique Y = Ymax.X/(X+X0,5)
    - les différents cas des ligands (compétitifs, incompétitifs et non compéttitifs)
    - B = Bmax.[L]/([L]+[L]0,5)
    et voilà, c'est à peut près tout ^^

    Merci de votre réponse !!

    -----


  2. #2
    noir_ecaille

    Re : Compréhension cours - Interactions Protéines-Ligands

    La constante de dissociation "apparente", j'ai du mal à voir d'où ça viendrait... Vous avez le contexte ?


    Ce ne serait pas plutôt :
    KD = [Protlibre]x * [Ligand]y / [complexe Prot-Ligand]
    Avec les "[...]" pour parler des concentrations et x et y les coeff de l'équation chimique ?

    D'où votre protéine avec un seule site de liaison :
    KD= [P]eq * [L]eq / [PL]eq
    [PL]eq = [P]eq * [L]eq / KD

    Plus d'infos ici : http://biochimej.univ-angers.fr/Page...oScatchard.htm


    Que sont Y et X dans votre fonction :
    Y = Ymax.X/(X+X0,5)


    Concernant Hill, il me semble que c'est une régression linéaire. On l'utilise pour la coopérativité des ligations (par exemple en fonction des gaz se liant à l'hémoglobine).
    Dernière modification par noir_ecaille ; 05/11/2014 à 03h08.
    "Deviens ce que tu es", Friedrich W. Nietzsche

  3. #3
    Great.J

    Re : Compréhension cours - Interactions Protéines-Ligands

    Bonjour,

    merci pour le lien déjà ^^ et puis pour le reste, ça m'aide déjà pas mal
    "ici se trouve le chemin, c’est ici que commence notre Grand Voyage."

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