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Séquences répétées en tandem



  1. #1
    safitchka

    Séquences répétées en tandem


    ------

    Bonsoir, je dois amplifier un gène dont la région C-terminale est composée par une séquence répétée en tandem: "GGTAAAGAA". Le but de mon travail consiste à séquencer ce gène afin de détecter le nombre de répétition de cette séquence.

    Voilà un exemple :

    séquence à amplifier :
    ATTCGGTACCGAATTTGGCCTAGCATGGGG ...........................GGT AAAGAAGGTAAAGAAGGTAAAGAAGGTAAA GAAGGTAAAGAAGGTAAAGAAGGTAAAGAA .

    Amorce sens: ATTCGGTACCGAATTTGG
    Amorce anti-sens: TTCTTTACCTTCTTTACC

    Ce que je veux comprendre est ce que l'amorce anti-sens va se lier à chacune des séquences répétées en tandem ? est ce que j'aurais plusieurs amplicons de taille différentes ? Si oui, comment pourrais-je amplifier tout le gène ?
    Merci d'avance

    -----

  2. #2
    Yoyo
    coresponsable des forums

    Re : Séquences répétées en tandem

    Salut

    Si jamais tu as plusieurs amplifications il serait logique de prendre la bande la plus grande.

    YOyo

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