Bonjour,
J'ai actuellement un souci pour déterminer la taille précise des introns et des exons dans une séquence d'ADNc donnée. Il me semble qu'un intron débute par un site donneur GT en 5' , qu'il contient un site de branchement contenant une Adénine et qu'il se termine par un site accepteur AG en 3'.
Le but est donc de rechercher toutes les régions entre un GT et un AG qui contiennent un A puis compter le nombre de nucléotides? Cela me semble long et bizarre étant donnée la taille de la séquence d'ADN (ADN complémentaire et non ARN).
Par ailleurs je dois déterminer la taille des régions UTR en 3' et 5' à l'aide d'une séquence d'acides aminés et de la séquence d'ADNc. Pour le coup, je connais les longueurs usuelles (entre 100 et 200 nucléotides pour UTR 5' et environ 1000 nucléotides pour URT 3'), mais je ne sais pas du tout comment trouver la longueur exacte !
Voila si quelqu'un connait la méthode.. Merci !
Rémy
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