Bonjour à tous,
Je suis en train de lire un article intitulé "Genetic predisposition to neuroblastoma mediated by a LMO1 super-enhancer polymorphism" (Oldridge et al, 2015).
Il y a deux notions que je ne comprends pas:
- Quelle est la différence entre une étude d'association conditionnelle et une étude d'association réciproque? Dans le papier ils expliquent qu'ils ont conditionnés le SNP leader pour voir si le signal de ce SNP n'était pas influencé par les signaux d'autres variants. Je ne comprends pas ce que veut dire "SNP conditionné" ni la différence entre les deux tests.
- Ils ont étudié l'expression de l'ARN messager au niveau de ce polymorphisme. Néanmoins, le SNP étant dans un intron, ils ont fait l'analyse sur un SNP homologue exonique. Je me demande comment on peut choisir ainsi un SNP "homologue", via quel principe?
Merci beaucoup de votre aide,
Giulialowa
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