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Biochimie Exons



  1. #1
    miniallache

    Biochimie Exons

    Bonjour ! J'ai une séquence d'un gène (ML16) et j'aimerai savoir comment on peut connaitre le nombre d'exons dans cette séquence. En gros comment le calculer. Merci

    -----


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  3. #2
    Tibosax

    Re : Biochimie Exons

    On ne peut pas connaitre le nombre d'exons dans un gène à partir de sa seule séquence non annotée. Il existe des algorithmes de prédictions d'exons/introns, mais j'imagine que ce n'est pas cela que tu cherches.

    Le plus simple reste encore de chercher ton gène sur Gennome Browser, mais ça n'est possible que si tu travailles chez une espèce dont le génome est séquencé et annoté.

    PS: Tu travailles chez quel espèce ? Je n'ai pas réussi à trouver de gène ML16 pour les quelques organismes eucaryotes couramment utilisés. Tu es sûr de son nom ?

  4. #3
    Flyingbike

    Re : Biochimie Exons

    j'allais écrire exactement la même chose que Tibosax : si le gène est "connu" tu peux avoir le détail de son épissage dans les bases de données et je pense que seule la corrélation transcrit/gène permet de déterminer la structure exon/intron du gène (donc expérimentalement)

    J'ai aussi cherché ML16 et je n'ai rien trouvé...
    La vie trouve toujours un chemin

  5. #4
    miniallache

    Re : Biochimie Exons

    C'est un exercice je ne pense pas que ce gène existe vraiment, en plus d'avoir cette séquence j'ai aussi la séquence du brin ARNc du coup j'ai pu trouver le nombre d'Exons en fonction de ce qui était codé et ce qui ne l'était pas. Maintenant on me demande de trouver le nombre de nucléotide de la région non codante 3' UTR mais j'ai aucune idée de comment y parvenir. Une aide ?

  6. #5
    Flyingbike

    Re : Biochimie Exons

    3'UTR est la région du messager, en 3', qui n'est pas traduite. Elle s'étend donc du stop à l'extrêmité.
    La vie trouve toujours un chemin

  7. A voir en vidéo sur Futura
  8. #6
    miniallache

    Re : Biochimie Exons

    Je peut la retrouver à partir de la séquence d'ADNc ou ADNg ?

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  10. #7
    Flyingbike

    Re : Biochimie Exons

    sur l'ADNc, puisque les UTR concernent les messagers...
    La vie trouve toujours un chemin

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