Un problème de northern blot !

[Guillmot]

Bonjour à tous !

Voilà, travaillant actuellement sur le gène patB d'Anabaena sp. (cyanobactérie), s'exprimant dans les hétérocystes, je me retrouve confronté à un problème de biologie moléculaire:

Les chercheurs de la publication réalisent un northern blot pour mettre en évidence la présence d'ARNm patB (hybridé avec une sonde), mais réalisent dans un second temps un northern blot "témoin" à l'aide d'ARNr 23S. Les données concernant l'ARNm patB sont ensuite dits normalisés par l'ARNr 23S et livrés sous forme de graphique.

J'ai du mal à saisir l'utilité de cette normalisation... Quelque'un aurait la solution ?

Merci d'avance !
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[Yoyo]

salut,

Les ARNr etant exprimes de facon quasi constantes dans les cellules. donc normaliser les resultats par rapport aux ARNr permet de t'assurer que si tu vois des variations d'intensites dans ton northern avec ton gene d'interet, cela ne proviens pas d'efficacite d'extraction differentes, d'efficacite de transfert sur la membrane differente, d'une degradation des ARN dans tone chantillon par une contamination par une RNAse etc...

bref cela te sert a t'assurer que les variations eventuelles (ou l'absence de variations) sont bien liees a des regulations de l'ARNm et non pas a des problemes techniques lors du Northen.

Yoyo

[Guillmot]

Merci Yoyo pour cette réponse ! Celà me permet de mieux comprendre les buts des auteurs de la publi lorsqu'ils présentent leurs résultats de northern blot !

@+
Guil