Bonjour,
J'aurais voulu savoir quels étaient les moyens basés sur de la spectrometrie de masse pour caractériser la structure d'une protéine? est-ce quelqu'un pourrait m'aider?
par exemple, est-ce possible de caractériser un pont disulfure par ms?
merci d'avance...
Caractériser la structure d'une protéine par MS, c'est un bien grand mot.
Par contre, une carte (souvent partielle malheureusement) des ponts disulfures est tout à fait faisable : après trypsination complète de la protéine, on compare la taille des fragments avec ou sans b-mercapto, on en déduit quel fragment est lié à quel autre, donc quelle cystéine peut être associée à quelle autre.
Ca c'est pas bete du tout...
Juste encore une précision sur la technique d'échange H/D. Avec ce genre d'approche, on peut obtenir une cartographie des régions en contact ou non avec le solvent, c'est ca?
et encore pour les techniques de cross-linking, on établit comment les cross-link?
merci d'avance...
Il me semble que les techniques d'echange H/D permettent effectivement de determiner des regions en contact ou non avec le solvant, mais je n'ai jamais pratique et je ne sais pas si ca marche bien ou pas.
Pour les techniques de cross-linking, ca doit marcher exactement comme avec les ponts disulfures qui sont d'une certaine facon des cross-linkant naturels.
