relation du pourcentage G+C avec la Tm

[Medical stdnt]

Bonjour à tous ,

J'ai bien compris qu'on peut savoir le G+C% à partir de la Tm , mais s'il vous plait , quelqu'un peut m'expliquer ce que cette courbe représente ?



Milles mercis d'avance
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[Pterygoidien]

Il indique simplement la relation entre l'absorbance relative d'un faisceau monochromatique de 260 nm et la température de fusion Tm. En fait, la température de fusion est la température à laquelle les deux brins de ton duplex d'ADN se séparent, et les acides nucléiques ont un pic d'absorbance pour la lumière UV à 260 nm. A la valeur de Tm, tu as en fait autant d'ADN en duplex que dissocié (ratio 1:1). En fait, la valeur de Tm est un indice de "stabilité thermique" qui va varier en fonction de la composition de ta séquence, mais aussi du nombre de bases. En fait, à mesure que tes duplex ADN vont se dissocier en brins individuels, l'absorbance optique de ton milieu va augmenter.

[Medical stdnt]

Bonsoir ,

Merci DarkSATAN pour votre réponse .

Et comment alors on a déduit la Tm à partir de la courbe ?

[dalmia]

Hello,

Pour une molécule d'ADN donnée, si tu te places au Tm, tu vas avoir 50% de molécules double-brins et 50% de molécules monobrins. Regarde ton graphe : on s'est placé à la moitié (50%) de la valeur max de la courbe pour venir trouver le Tm en abscisse.

Dalmia

[A voir en vidéo sur Futura]

[YB17]

Bonjour,

Ce que dit Dalmia est exact, par contre il ne faut pas pour autant que tu oublies de tenir compte du fait que Abs260 minimale n'est pas égale à 0. Du coup sur ta courbe la Tm ne correspond pas directement à 50% de la température pour laquelle on mesure l'abs260 maximale mais plutôt à la température sur ta courbe qui correspond à Absmin +(Absmax-Absmin)/2

[Medical stdnt]

bonjour ,

Et en fin c'est compris , Un grand merci pour vos réponses DarkSATAN , dalmia , YB17 <3