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relation du pourcentage G+C avec la Tm



  1. #1
    Medical stdnt

    Question relation du pourcentage G+C avec la Tm


    ------

    Bonjour à tous ,

    J'ai bien compris qu'on peut savoir le G+C% à partir de la Tm , mais s'il vous plait , quelqu'un peut m'expliquer ce que cette courbe représente ?

    a.png

    Milles mercis d'avance

    -----

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  3. #2
    Pterygoidien

    Re : relation du pourcentage G+C avec la Tm

    Il indique simplement la relation entre l'absorbance relative d'un faisceau monochromatique de 260 nm et la température de fusion Tm. En fait, la température de fusion est la température à laquelle les deux brins de ton duplex d'ADN se séparent, et les acides nucléiques ont un pic d'absorbance pour la lumière UV à 260 nm. A la valeur de Tm, tu as en fait autant d'ADN en duplex que dissocié (ratio 1:1). En fait, la valeur de Tm est un indice de "stabilité thermique" qui va varier en fonction de la composition de ta séquence, mais aussi du nombre de bases. En fait, à mesure que tes duplex ADN vont se dissocier en brins individuels, l'absorbance optique de ton milieu va augmenter.

  4. #3
    Medical stdnt

    Re : relation du pourcentage G+C avec la Tm

    Bonsoir ,

    Merci DarkSATAN pour votre réponse .

    Et comment alors on a déduit la Tm à partir de la courbe ?

  5. #4
    dalmia

    Re : relation du pourcentage G+C avec la Tm

    Hello,

    Pour une molécule d'ADN donnée, si tu te places au Tm, tu vas avoir 50% de molécules double-brins et 50% de molécules monobrins. Regarde ton graphe : on s'est placé à la moitié (50%) de la valeur max de la courbe pour venir trouver le Tm en abscisse.

    Dalmia

  6. #5
    YB17

    Re : relation du pourcentage G+C avec la Tm

    Bonjour,

    Ce que dit Dalmia est exact, par contre il ne faut pas pour autant que tu oublies de tenir compte du fait que Abs260 minimale n'est pas égale à 0. Du coup sur ta courbe la Tm ne correspond pas directement à 50% de la température pour laquelle on mesure l'abs260 maximale mais plutôt à la température sur ta courbe qui correspond à Absmin +(Absmax-Absmin)/2
    Dernière modification par YB17 ; 17/10/2018 à 22h46. Motif: grammaire

  7. A voir en vidéo sur Futura
  8. #6
    Medical stdnt

    Re : relation du pourcentage G+C avec la Tm

    bonjour ,

    Et en fin c'est compris , Un grand merci pour vos réponses DarkSATAN , dalmia , YB17 <3

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