Calcul du taux d'hétérozygotie

[Sousou]

Dans mon DM, on me demande de comparer la variabilté génétique de la population 2015 avec celle de 2021 en utilisant le taux d'hétérozygotie et d'expliquer. pouvez-vous me dire si je me suis trompée

voilà ce que j'ai fais :
Pour comparer la variabilité génétique de la population en 2015 avec celle de 2021, nous allons utiliser le taux d'hétérozygotie, qui mesure la diversité génétique au sein de la population.
Le taux d'hétérozygotie peut être calculé en utilisant la formule suivante :
H = 1-(n11/n)^2
Avec
H est le taux d'hétérozygotie
n11 représentent le nombre d'individus ayant les génotypes hétérozygotes
n est le nombre total d'individus
Pour l'année 2015, les données sont les suivantes :
Nombre total d'individus (n) = 42
Nombre d'individus de génotype Cox2/Cox2 (n11) = 12
H2015 = 1 − (12/42)2
H2015 ≈ 0.9184

Pour l'année 2021, les données sont les suivantes :
Nombre total d'individus (n) = 18
Nombre d'individus de génotype Cox2/Cox2 (n11) = 2
En utilisant ces données, nous pouvons calculer le taux d'hétérozygotie pour 2021.
H2021 = 1 – (2/18)2
H2021 ≈ 0.9877

voici les données fournis


2015 abondance 42 individus dont 12 de génotype cox2/cox2
2021 abondance 18 individus dont 2 de génotype cox2/cox2
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[MissJenny]

le taux d'hétérozygotie est égal à 1 moins la somme des carrés des fréquences alléliques. Si tu as 2 allèles de fréquences p et (1-p) c'est donc 1-p^2-(1-p)^2

[Sousou]

donc je me suis trompée dans la formule mais je fais comment pour calculer p.
p est-il egale à 12/42 et 1-p à 2/18

donc 1-(12/42)^2-(1-2/18)^2

ou faut-il que je fasse un calcul pour chaque
1-(12/42)^2-(1-12/42)^2
et
1-(2/18)^2-(1-2/18)^2

[MissJenny]

c'est difficile pour moi de lire l'image jointe (privilège de l'âge...) mais je vois que tu n'as pas toutes les données. On va supposer qu'il n'y a que 2 allèles, dont l'un est Cox2. Tout ce que tu connais c'est la fréquence du génotype Cox2/Cox2. Tu ne peux pas calculer la fréquence allélique de Cox2. Pour cela il te faudrait la fréquence du génotype Cox2/X (si X est le nom de l'autre allèle). Je pense que dans ce cas le plus simple est de supposer que la population est dans l'équilibre de Hardy-Weinberg, et donc que le génotype Cox2/Cox2 a pour fréquence le carré de la fréquence allélique de Cox2. Tu n'as pas besoin d'élever 12/42 au carré. Par contre il faut faire un calcul pour l'autre carré... je te laisse terminer.

[A voir en vidéo sur Futura]

[Sousou]

Bonjour.
je n'ai que ces données pour faire l'exercice, c'est pour ça que je suis perdue.
on me dit que l'étude des microsatellites s'est réalisé sur le gène cox qui comprend deux versions l'allèle Cox1 et l'allèle Cox2 (dessin)
puis on me donne en résultats:
En 2015 une abondance de 42 avec un nombre d'individus de génotype cox2/cox2 de 12
En 2018 une abondance de 18 avec un nombre d'individus de génotype cox2/cox2 de 2
Donc la fréquence de cox2/cox2 serait de 12/42 soit 0.29 et donc les fréquences de cox1/cox1 et cox1/cox2 réunis seraient de 0.71
mais là encore je bloque;
je ne peux pas utiliser la formule p^2+2pq+q^2

[Sousou]

alors j'ai essayé d'appliquer le principe d'équilibre de Hardy-Weinberg
pouvez vous me dire si j'ai bon cette fois-ci

En 2015
Dans notre exemple, les génotypes possibles sont homozygote dominant (cox1/cox1), hétérozygote (cox1/cox2) et homozygote récessif (cox2/cox2).
Si nous ne pouvons observer que les phénotypes dans la population, alors nous ne connaissons que le phénotype récessif (cox2/cox2). Par exemple, dans un jardin de 42 papillons, 30 peuvent avoir cox1 et 12 cox2. Nous ne savons pas combien sont homozygotes dominants (cox1/cox2) ou hétérozygotes (cox2/cox1), mais nous savons que 12 d’entre eux sont homozygotes récessifs (cox2/cox2).
Par conséquent, en connaissant le phénotype récessif et, par conséquent, la fréquence de ce génotype (12 sur 42 individus ou 0,29), nous pouvons calculer le nombre d’autres génotypes.
Si q2 représente la fréquence des papillons homozygotes récessives, alors q2 = 0,29. Par conséquent, q = 0,54.
Comme p + q = 1, alors 1 – 0,54 = p, et nous savons que p = 0,46.
La fréquence des plantes homozygotes dominantes (p2) est de (0,46)2 = 0,21.
Sur 42 papillons, il y a 9 papillons cox1/cox1.
La fréquence des plantes hétérozygotes (2pq) est 2(0,46)(0,56) = 0,5. Par conséquent, 21 papillons sur 42 sont hétérozygotes (cox1/cox2).

En 2021 :
Dans notre exemple, les génotypes possibles sont homozygote dominant (cox1/cox1), hétérozygote (cox1/cox2) et homozygote récessif (cox2/cox2).
Si nous ne pouvons observer que les phénotypes dans la population, alors nous ne connaissons que le phénotype récessif (cox2/cox2). Par exemple, dans un jardin de 18 papillons, 16 peuvent avoir cox1 et 2 cox2. Nous ne savons pas combien sont homozygotes dominants (cox1/cox2) ou hétérozygotes (cox2/cox1), mais nous savons que 2 d’entre eux sont homozygotes récessifs (cox2/cox2).
Par conséquent, en connaissant le phénotype récessif et, par conséquent, la fréquence de ce génotype (2 sur 18 individus ou 0,11), nous pouvons calculer le nombre d’autres génotypes.
Si q2 représente la fréquence des papillons homozygotes récessives, alors q2 = 0,11. Par conséquent, q = 0,33.
Comme p + q = 1, alors 1 – 0,33 = p, et nous savons que p = 0,67.
La fréquence des plantes homozygotes dominantes (p2) est de (0,67)2 = 0,44.
Sur 18 papillons, il y a 8 papillons cox1/cox1.
La fréquence des plantes hétérozygotes (2pq) est 2(0,67)(0,33) = 0,44. Par conséquent, 8 papillons sur 42 sont hétérozygotes (cox1/cox2).

en conclusion en 2015 on a une plus grande variabilité génétique qu'en 2021?

[Sousou]

je dois egalement calculé le taux d'accroissement intrinsèque.
pouvez-vous me dire si j'ai bon

Estimer le taux d’accroissement intrinsèque naturel de la population entre 2006 et 2015 (donner les étapes conduisant à votre résultat)

Le taux d'accroissement intrinsèque naturel (r) peut être estimé à l'aide de la formule de croissance exponentielle :

N = N0 × ert
Avec
N est la taille de la population à un moment donné (42 individus en 2015)
N0 est la taille de la population initiale (14 individus en 2006)
r est le taux d'accroissement intrinsèque naturel
t est le temps écoulé (9 années entre 2006 et 2015)

Pour estimer r, nous pouvons utiliser les données de population de 2006 et 2015.

Ce qui donne

N = N0 × ert soit 42 = 14×er×9

r = ln⁡(42/14)/9 ≈ 0.139

Le taux d'accroissement intrinsèque naturel estimé de la population est d'environ 0.14 par an.
Cela indique que, en l'absence de toute influence externe, la population d'azurés des mouillères aurait augmenté d'environ 14 % par an entre 2006 et 2015.

[MissJenny]

je trouve plutôt 13%. J'écris 42 = 14*(1+a)^9 où a est le taux d'accroissement annuel. Ca donne a = (42/14)^(1/9) - 1 = 0.130 (environ)

[Sousou]

merci pour votre aide