L'urée dans un protocole de digestion tryptique de protéines

[simplymelolo]

voila j'ai un petit soucis

a quoi sert l'urée dans un protocole de digestion tryptique de protéines???

je ne comprend pas du tout son role

Merci de votre aide
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[Trapamoosch]

L'urée est un dénaturant. Il faut savoir que la trypsine a du mal à digérer les protéines qui sont trop repliées à cause, par exemple, de la présence de ponts disulfures entre différents acides aminés.
L'action dénaturante permet de déplier la structure afin de laisser de la place à l'enzyme pour agir. Tu verras parfois aussi l'utilisation de guanidine, de dithiothréitol ou de Tris-HCl.

[Zellus]

Bonsoir,

L'urée est un dénaturant. Il faut savoir que la trypsine a du mal à digérer les protéines qui sont trop repliées à cause, par exemple, de la présence de ponts disulfures entre différents acides aminés.
L'action dénaturante permet de déplier la structure afin de laisser de la place à l'enzyme pour agir. Tu verras parfois aussi l'utilisation de guanidine, de dithiothréitol ou de Tris-HCl.

Juste pour préciser : l'urée tout comme la guanidine sont des dénaturants puissants qui établissent de nombreuses liaisons hydrogène avec les acides aminés, mais ils ne détruisent pas les ponts disulfures (enfin j'ai peut-être mal interprété ce que tu voulais dire). Pour rompre ces ponts disulfures, on utilise des agents réducteurs comme le dithiothréitol ou le 2-mercaptoéthanol.
Mais bon sinon je suis d'accord avec ta réponse sur le rôle de l'urée qui aide la trypsine à mieux digérer.
Par contre, le Tris-HCl n'est pas un agent dénaturant mais est utilisé pour tamponner les solutions dans lesquelles on utilise les protéines.

[simplymelolo]

Merci pour vos réponses
c est génial!!!

suis trop contente lol

merci beaucoup de votre aide

[A voir en vidéo sur Futura]

[Trapamoosch]

Bonsoir,


Juste pour préciser : l'urée tout comme la guanidine sont des dénaturants puissants qui établissent de nombreuses liaisons hydrogène avec les acides aminés, mais ils ne détruisent pas les ponts disulfures (enfin j'ai peut-être mal interprété ce que tu voulais dire). Pour rompre ces ponts disulfures, on utilise des agents réducteurs comme le dithiothréitol ou le 2-mercaptoéthanol.
Mais bon sinon je suis d'accord avec ta réponse sur le rôle de l'urée qui aide la trypsine à mieux digérer.
Par contre, le Tris-HCl n'est pas un agent dénaturant mais est utilisé pour tamponner les solutions dans lesquelles on utilise les protéines.

Oui effectivement l'urée ne réduit pas les ponts disulfures, ma réponse prêtait à confusion.
Idem pour le Tris-HCl, à force de le voir dans les protocoles, je l'ai cité par erreur, au temps pour moi