Problème débenzylation

[invite85534395]

Bonjour,

j'ai un problème de débenzylation au moyen de Pd/C dans l'AcOEt pour des peptides modifiés par l'ajout d'un atome d'azote en lieu et place de hydrogène pour un lien amidique sur deux. Alors que pour des enchainements Phe-Ala je n'ai rencontré aucun soucis de déprotyection pour des enchainements Gly-Gly la débenzylation de l'hexamère fut impossible dans ces conditions, l'ajout d'acide acétique n'y changeant de même que l'utilisation du micro-ondes au moyen de cyclohexadiene. Est ce que quelqu'un aurait une explication ?

Merci d'avance

Maxime
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[inviteb7fede84]

Bonjour. Peux-tu écrire de façon explicite une réaction qui marche et une qui ne marche pas ?

[invite85534395]

oups erreur de schéma :


Merci d'avance

[HarleyApril]

bonsoir

le lecteur attentif rectifie le COOBn en COOH dans les deux produits du schéma
le modérateur ôte le schéma qui ne correspond pas à ce fil

je suppose que tu as vérifié que ton peptide était bien soluble dans le solvant ... il se peut qu'il vienne chélater et inactiver ton palladium
tu peux essayer des alcools, c'est bien pour les hydrogénations
sinon, le plus efficace est souvent l'hydrogénation en utilisant le mélange eutectique acide formique triéthylamine (et le palladium)

une saponification ne sera pas possible, le phtalimide s'ouvre avant que l'ester ne réagisse

cordialement

[A voir en vidéo sur Futura]

[inviteb7fede84]

On peut envisager un empoisonnement du Pd/C par ton échantillon (impureté)? Une méthode: filtrer au préalable sur charbon actif ta solution...

Pense à rectifier tes schémas...

[invite85534395]

Merci pour vos réponses.

J'écarte la piste de l'empoisonnement. Les réactions se sont faits avec le même Pd/C et celui-ci fonctionne très bien.
En ce qui concerne la solubilité : j'ai été contraint d'utiliser de l'AcOEt plutôt que de l'éthanol. J'ai préféré éviter le méthanol avec lequel j'ai observé une dégradation de mes composés lors d'essais de cristallisation.

La question que je me pose : c'est pourquoi pour la glycine on observe ce phénomène, un phénomène de repliement de la chaine pourrait-il expliquer cela, rendant ainsi l’interaction entre le palladium et la molécule plus difficile ? Dans ce cas le fait d'utiliser une température de 100°C aux micro-ondes ne devrait-il permettre une certaine mobilité de la molécule rendant accessible l’extrémité C-terminale ?

[inviteb7fede84]

Merci pour vos réponses.

J'écarte la piste de l'empoisonnement. Les réactions se sont faits avec le même Pd/C et celui-ci fonctionne très bien.
En ce qui concerne la solubilité : j'ai été contraint d'utiliser de l'AcOEt plutôt que de l'éthanol. J'ai préféré éviter le méthanol avec lequel j'ai observé une dégradation de mes composés lors d'essais de cristallisation.

J'envisageai plutôt un empoisonnement du Pd/C par un contaminant dans ton échantillon à hydrogéner d'où la proposition de filtrer au préalable ta solution sur charbon actif ou sur célite.