[R] Problème sur une ANOVA
Répondre à la discussion
Affichage des résultats 1 à 5 sur 5

[R] Problème sur une ANOVA



  1. #1
    invite3a8ed84a

    Question [R] Problème sur une ANOVA


    ------

    Bonjour à tous !

    je vous explique mon sujet : je cherche à déterminer quels facteurs influencent le plus une teneur en champignon (lnEF1a_Fgraminearum, qui est en log) après une récolte ... qui pourrait s'expliquer par plusieurs variables (toutes qualitatives). Je décide donc de faire une ANOVA ! (je ne sais pas si c'est la meilleure idée mais bon..)

    Voici un bout de mon script :
    Code:
    res.lm <- lm( lnEF1a_Fgraminearum ~ -1 + V3 + V4 + V21 + V23 + V16 + V17 + V21 + V35 , data = data)
    anova(res.lm)
    summary(res.lm)
    residuals(res.lm)
    hist(residuals(res.lm))
    curve(dnorm(x,0,sd=sd(residuals(res.lm))), add=T, lwd=2, col="red")
    J'ai quelques soucis : lorsque je veux rajouter une variable explicative, j'ai le message d'erreur suivant :
    Erreur dans `contrasts<-`(`*tmp*`, value = contr.funs[1 + isOF[nn]]) :
    les contrastes ne peuvent être appliqués qu'aux facteurs ayant au moins deux niveaux

    1) Je ne sais pas pourquoi R refuse que je rajoute certaines variables, avez vous une idée ?
    2) Lorsque je fais mon histogramme de la distribution des résidus, la fonction curve() que j'applique renvois une courbe qui ne suit pas du tout une loi normale
    Nom : residu anova.jpeg
Affichages : 158
Taille : 42,2 Ko

    j'ai du rater quelque chose dans ma ligne curve()


    ...

    Merci !

    -----

  2. #2
    invite179e6258

    Re : [R] Problème sur une ANOVA

    le message d'erreur laisse penser qu'une variable du modèle est constante.

    et quant à la densité gaussienne, il faut la multiplier par le nombre de résidus (qui est le nombre d'observations).

  3. #3
    invite3a8ed84a

    Re : [R] Problème sur une ANOVA

    Euu merci ca me donne une bien plus jolie répartition (même si je suis pas sûre du tout que ce soit "autorisé")
    mais ca ne change rien à ma curve !!! :'(

  4. #4
    invite179e6258

    Re : [R] Problème sur une ANOVA

    il ne faut pas utiliser la fonction curve.

    ou sinon, tu peux faire

    hist(residuals(res.lm),freq=F)
    curve(dnorm(x,0,sd=sd(residual s(res.lm))), add=T, lwd=2, col="red")

  5. A voir en vidéo sur Futura
  6. #5
    invite3a8ed84a

    Re : [R] Problème sur une ANOVA

    Ça ne marche pas non plus ...

    J'avais l'habitude d'utiliser curve() et tout allait bien ..

    je vais essayer avec line() ou abline()

Discussions similaires

  1. gros problème ANOVA deux facteurs
    Par invitec7cfcba7 dans le forum Mathématiques du supérieur
    Réponses: 0
    Dernier message: 08/04/2012, 16h17
  2. problème ANOVA sous R
    Par invite24f624b1 dans le forum Mathématiques du supérieur
    Réponses: 4
    Dernier message: 29/06/2011, 14h21
  3. Problème pour réaliser une ANOVA
    Par invite4f81e180 dans le forum Mathématiques du supérieur
    Réponses: 14
    Dernier message: 10/06/2009, 10h44
  4. Statistique sur R (anova)
    Par invite8b118ae7 dans le forum Mathématiques du supérieur
    Réponses: 1
    Dernier message: 27/05/2009, 16h22
  5. question sur le nombre minimum d'observations à avoir pour pouvoir faire une ANOVA?
    Par invite7323c4b6 dans le forum Mathématiques du supérieur
    Réponses: 2
    Dernier message: 22/05/2009, 11h11
Dans la rubrique Tech de Futura, découvrez nos comparatifs produits sur l'informatique et les technologies : imprimantes laser couleur, casques audio, chaises gamer...