Statistique sur R (anova)

[invite8b118ae7]

Bonjour,


je suis étudiant et actuellement en stage... et en plein désespoir..

J'ai enfin fini d'entrer mes données sur excel... mais probleme: mes tests ne fonctionne pas! et j'ai un probleme pour la rédaction de l'un d'eux...


Déjà le choix du test:

je compare 2 espèces qui ont subis 6 traitements différents et j'ai relevé différents caractères. (oui c'est de la bio.. je sais pas si je peux poster ici.. mais je tente quand même ^^ )

sur excel mes colones sont:
- espèce: AT ou AJ (initial de leur nom scientifique..)
- traitement: le n° code du traitement
- nom de l'individu
- masse
- taille
- longévité
- fécondité
etc


Donc je pensais faire une ANOVA de tout ça sur R mais il faut vraiment que je tienne compte de l'espèce et du traitement à chaque fois... Je n'arrive pas à réussir mon test de normalité et surtout d'homoscédasticité!!

En fait, j'avais ma matrice sur R. J'ai fait une ANOVA pour la longévité en tapant ceci sur R (ici en plus clair):

> Longévité=aov(longévité~traite ment*espèce)

Ensuite:
> summary(longévité)
Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)
traitement 3 7162 2387 2.9114 0.03654 *
espèce 1 16824 16824 20.5174 1.219e-05 ***
traitement:espèce 3 1290 430 0.5243 0.66623
Residuals 146 119719 820


Donc là 1er problème! p<<0,05!

Au cas où j'essaie mon test de Levene:
levene.test(Longévité,interact ion(traitement*espèce))

là ça marche pas du tout! Comment je peux faire pour que mon test de Levene fonctionne? Comment je peux lier le traitement et l'espèce pour mon test?

Voilà j'espère que vous pourrez m'aider
Merci d'avance
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[invite8b118ae7]

dsl petit probleme dans mes explications^^

et le menu editer n'a pas voulu fonctionner....

voilà le "vrai" message


Bonjour,


je suis étudiant et actuellement en stage... et en plein désespoir..

J'ai enfin fini d'entrer mes données sur excel... mais probleme: mes tests ne fonctionne pas! et j'ai un probleme pour la rédaction de l'un d'eux...


Déjà le choix du test:

je compare 2 espèces qui ont subis 6 traitements différents et j'ai relevé différents caractères. (oui c'est de la bio.. je sais pas si je peux poster ici.. mais je tente quand même ^^ )

sur excel mes colones sont:
- espèce: AT ou AJ (initial de leur nom scientifique..)
- traitement: le n° code du traitement
- nom de l'individu
- masse
- taille
- longévité
- fécondité
etc

(PS quand je n'ai pas de données pour certains individus (soit en longévité soit en fécondité par exemple) je mets des NA... donc plein de NA dans mon tableau)
Donc je pensais faire une ANOVA de tout ça sur R mais il faut vraiment que je tienne compte de l'espèce et du traitement à chaque fois... Je n'arrive pas à réussir mon test de normalité et surtout d'homoscédasticité!!

En fait, j'avais ma matrice sur R. J'ai fait une ANOVA pour la longévité en tapant ceci sur R (ici en plus clair):

> Longévité=aov(longévité~traite ment*espèce)

Ensuite:
> summary(Longévité)
Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)
traitement 3 7162 2387 2.9114 0.03654 *
espèce 1 16824 16824 20.5174 1.219e-05 ***
traitement:espèce 3 1290 430 0.5243 0.66623
Residuals 146 119719 820

Je fais mon test de Shapiro:
shapiro.test(Longévité)---> fonctionne pas
shapiro.test(Longévité$residua ls)
Shapiro-Wilk normality test

Longévité$residuals
W = 0.969, p-value = 0.001510

Donc là 1er problème! p<<0,05!

Au cas où j'essaie mon test de Levene:
levene.test(long,interaction(t raitement*espèce))

J'ai tenté tout betement: levene.test(Longévité) et ça me donne quelque chose mais je ne sais pas si ça prend en compte l'interaction espèce/traitement pour vérifier l'homoscédasticité...

Avec levene.test(Longévité$residual s)
là ça marche pas du tout! Comment je peux faire pour que mon test de Levene fonctionne? Comment je peux lier le traitement et l'espèce pour mon test?

Voilà j'espère que vous pourrez m'aider
Merci d'avance