Bonjour
La liaison peptidique qui lie les acides aminés (de la série D) entre eux peuvent former un grand nombre de conformations différentes.
Certaines de ces conformations forment des hélices circulaires tournant dans le sens trigonométrique ( alpha).
J'ai calculé toutes les conformations possibles d'une 'petite' protéine de 4 acides aminés en précisant dans un tableau de matrices les composantes x y z de tous les atomes
de cette petite protéine.
Je cherche par une boucle de calcul lesquelles des conformations forment une hélice alpha.
pour une conformation donnée qui précise les coordonnées x,y,z de n atomes, existe-il une hélice alpha qui passe par n points de cette conformation
Y a t-il un critère qui permet de préciser s'iil existe une solution?
Si oui comment déterminer les paramètres de cette hélice?
Combien de paramètres faut il connaitre pour tracer une hélice circulaire alpha?
d'avance Merci
Maydat
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