ACP : interprétation graphique
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ACP : interprétation graphique



  1. #1
    RED

    ACP : interprétation graphique


    ------

    Bonjour, je dois réaliser de la typologie de cancer avec des marqueurs mais j'ai du mal à lire le graphique mélangeant les variables quantitatives (les marqueurs) et les types de cancers. S'il vous plaît, si quelqu'un pouvait me venir en aide ou me donner des explications ce serait génial.

    Le graphique :

    Pièce jointe 504592




    Merci,
    Bonne journée.

    -----

  2. #2
    Rhopi

    Re : ACP : interprétation graphique

    Bonjour,

    impossible d'ouvrir la pièce jointe!

  3. #3
    RED

    Re : ACP : interprétation graphique

    Bonjour merci sincèrement pour votre réponse je commence à désespérer avec ce graphique...

    Je réessaye, j'espère que c'est bon cette fois Nom : Capture d'écran 2025-01-27 161758.png
Affichages : 63
Taille : 42,0 Ko

    https://docs.google.com/document/d/1...k/edit?tab=t.0


    https://docs.google.com/document/d/1...k/edit?tab=t.0

  4. #4
    gts2

    Re : ACP : interprétation graphique

    Bonjour,

    Pour moi, c'est tout aussi incompréhensible : que représentent les deux axes ? que représente d (de d=1) ?

  5. A voir en vidéo sur Futura
  6. #5
    RED

    Re : ACP : interprétation graphique

    Les 2 axes représentent une maximisation de la variance, c'est à nous d'y donner du sens l'ACP ne fait que concentrer toute la variabilité autour de ces axes, pour d=1 je ne sais pas du tout ce que c'est.
    Si ça peut aider il y'a le cercle des corrélation concernant les marqueurs tumorales qui sont les variables quantitatives dans ce travail :
    Capture d'écran 2025-01-28 082019.png

    Je peux aussi mettre à disposition une partie du jeu de données, en tout cas l'interprétation du 1er graphe me bloque totalement un coup de main m'aiderait vraiment...

    Capture d'écran 2025-01-28 082219.png

  7. #6
    MissJenny

    Re : ACP : interprétation graphique

    c'est une représentation sur un même graphique des corrélations entre variables (les marqueurs) et des barycentres des nuages de points correspondant à chaque type de cancer.

    tu as utilisé le package ade4. Si tu cherches sur le site de l'université de Lyon 1 tu trouveras des documents qui expliquent bien ces analyses (mieux que je ne saurais le faire)

    c'est ici : http://pbil.univ-lyon1.fr/ade4/home.php

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