coiffe, poly A ARNm matures

[inviteb40cc2e8]

Bonjour,
J'ai juste une petite question: pourquoi sur les ARNm mature, la coiffe est en 5' et le poly A en 3' ?
Quelles seraient les conséquences si ce n'était pas le cas?
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[invitec9f0f895]

salut

chez les eucaryotes la coiffe permet aux facteurs de l'initiation de la traduction de se fixer. Donc sans coiffe pas de traduction (c'est d'ailleur comme ca que certains virus detournent la machinerie de la cellule). sans queue polyA l'ARNm est instable, il est possible qu'elle joue un role dans la traduction en permettant une circularisation de la molecule d'ARN

Yoyo

[inviteb40cc2e8]

Merci bcp, ça m'éclaire bien sur le rôle de ces deux éléments.
Et je voulais aussi savoir pourquoi la séquence des exons traduits dans un ARNm mature se trouve forcement plus près de l'extrémité 5' que de 3'? C'est à dire: pourquoi la séquence d'exons non traduits du côté 3' est très longue et celle du côté 5' courte? Est ce que c'est toujours le cas?

[invite5351d78c]

Salut,

sans coiffe pas de traduction

Il existe des exceptions, certains gènes eucaryotes possèdent des séquences IRES qui permettent une initiation de la traduction interne. Mais la traduction cap-dépendante reste la grande majoritaire.

il est possible qu'elle joue un role dans la traduction en permettant une circularisation de la molecule d'ARN

C'est pas que c'est possible, c'est quasiment sûr étant donné qu'une intéraction a été démontrée entre polyABP et une protéine de l'initiation de la traduction, eIF4E je crois. Et puis ce concept commence à être largement accepté puisque dans le film "the inner life of the cell", on voit les ARNm qui se circularisent avant traduction. Ce système serait logiquement avantagé si on se place d'un point de vue évolutionniste car cette circularisation lierait spatialement la terminaison de la traduction à l'initiation et faciliterait donc la réinitiation.

Et je voulais aussi savoir pourquoi la séquence des exons traduits dans un ARNm mature se trouve forcement plus près de l'extrémité 5' que de 3'

J'étais pas au courant de ça. Par contre je sais q'en principe l'exon le plus long est le premier exon c'est à dire celui situé le plus vers le 5'.

la séquence d'exons non traduits

Ce terme n'existe pas. Une séquence d'ADN non traduite est un intron.

A+

[A voir en vidéo sur Futura]

[invitec9f0f895]

C'est pas que c'est possible, c'est quasiment sûr étant donné qu'une intéraction a été démontrée entre polyABP et une protéine de l'initiation de la traduction, eIF4E je crois. Et puis ce concept commence à être largement accepté puisque dans le film "the inner life of the cell", on voit les ARNm qui se circularisent avant traduction. Ce système serait logiquement avantagé si on se place d'un point de vue évolutionniste car cette circularisation lierait spatialement la terminaison de la traduction à l'initiation et faciliterait donc la réinitiation.

Eh bien non désolé mais pour l'instant ce n'est qu'un joli modele qui n'a jamais formellement ete demontré! Certe l'ARN peut eventuellement se circulariser, mais je vois mal en quoi lier spatialement la terminaison de la traduction avec l'initiation offre un quelqueconque avantage, mais surtout en quoi ces deux evenements pourraient etre liés.
On lit beaucoup de chose la dessus, mais il faut faire la part des choses entre ce qui est clairement démontré, ce qui est dit avec une demonstration douteuse, et ce que certains croient.

Yoyo

[invite5351d78c]

Bein c'est à dire que ce modèle doit quand même être assez concret puisque deux profs différents nous ont fait des cours où ils énoncaient la circularisation des ARNm. Et parmi ces deux profs, l'un d'eux a travaillé sur la traduction, sur les IRES plus particulièrement, et il est assez renommé (cela ne fait pas tout, mais la renommée arrive rarement par hasard..). Et si des gens de Harvard ont fait un film montrant l'ARNm se circulariser, c'est que ce modèle commence à largement se répandre parmi les mentalités.

PS : au fait, l'avantage de réinitiation c'est le prof qui l'a sorti, pas moi . Et ce prof est vraiment très fort (cela engage toute ma promo, aucun n'en doute).

[invitec9f0f895]

Salut

Je ne doute pas que ton prof soit tres tres fort, mais l'avantage est plus qu'une hypothese. elle est reprise par pas mal de monde sans pour autant reflechir beaucoup plus loin!
Le recyclage des ribosomes n'est qu'hypothetique et loin d'etre démontrée. Cela arrange les personnes proposant ce modele de circularisation. pourquoi aller imaginer de tels mecanismes alors que la circularisation peut en elle meme conférer un avantage, par exemple, en protégeant l'ARN de la degradation ...
Faut pas croire tout ce qu'on vous raconte en cours

Yoyo

[inviteb40cc2e8]

la séquence d'exons non traduits

Ce terme n'existe pas. Une séquence d'ADN non traduite est un intron.

Je pensais qu'un ARNm était fait d'une suite de plusieurs exons, un seul codant pour une protéine spécifique. Ceux qui ne codent pas pour cette protéine ne sont pas des "exons non traduits" ?

[invitec9f0f895]

Ce terme n'existe pas. Une séquence d'ADN non traduite est un intron.

A+

désolé j'avais raté cette phrase. ce n'est evidemment pas vrai, les sequences 5' et 3' non traduites (avant l'ATG et apres le codon stop) sont des exons, mais ne sont pas traduits.

Yoyo

[inviteb40cc2e8]

merci, ça me rassure, j'étais en train de me dire que j'avais vraiment rien compris...