Regulation des gènes chez les eucaryotes

[invitec67a8077]

bonjour, j ai du mal a comprendre le mécanisme de régulation des génes chez les eucaryotes, l homme plus précisement... pouviez vous m aider... merci
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[MaliciaR]

Bonjour,

C'est un très vaste domaine... Votre question demande un cours titanesque sur le sujet et je ne pense pas que quelqu'un le fasse Mais si vous avez des questions précises, posez-les et on vous apportera des réponses si on le prut


Cordialement,

[invite217f3aaa]

Salut, whouais pas facil ! Mais pour commencer, tout ce que je connais des mécanismes de régulation génétique ( et non mécanismes génétiques de régulation ) des eucaryotes est commun à tous les eucaryotes, pas de différences fondamentales entre un homme et un autre eucaryote AMHA.

Désolé ce n'est pas un concept assez "limpide" pour moi au point de pouvoir le résumer comme cela en quelques phrases.

[jmbowie]

bonjour, j ai du mal a comprendre le mécanisme de régulation des génes chez les eucaryotes, l homme plus précisement... pouviez vous m aider... merci

Parlez-vous de la régulation de l'expression des gènes? de leur biosynthèse? de leur réparation?

[A voir en vidéo sur Futura]

[invitec67a8077]

je sais que c est pas facile a expliqué en quelque ligne, c pour cela que je vais fragmenté ma question .. comment ce fait la regulation en cis au niveau transcriptionel??? c ma premiere qestion .... thx a lot

[mnafati]

Bonjour,

La question est effectivement tres tres vague, ou plutot attend une reponse de la taille d'un bouquin. D'autant plus que tu as l'air de t'intéresser plutot a l'homme, ce qui demande deja des connaissances sur des mécanismes plus généraux. Je vais juste te donner quelques clés qui vont expliciter étapes par étapes les différents mécanismes de régulation.
Pour rendre cela plus intuitif, je vais imager mon discours

1/ Régulation au niveau transcriptionnelle
On entend par niveau d'expression d'un gène le niveau de production production d'un arn messager.
Imagine que le génome soit une bibliothèque contenant les plans de différentes machines de chantier. Chaque plan n'est présent qu'en quantité limitée, généralement une seule copie, bien qu'il puisse exister des duplicats. Comme il y a peu d'originaux, il est nécéssaire de faire des copies temporaires des plans, qui elles serviront a la construction. Ces copies sont les arn messagers.
Pour produire les arns messagers, il existe une machinerie appellée machinerie transcriptionnelle (c'est la photocopieuse si tu veux). Comme la plupart de gènes ne doivent s'exprimer qu'a certains moments, il existe des facteurs de transcription qui vont conditionner la production ou non des arn messagers par la machinerie transcriptionnelle. C'es facteurs de transcription sont des protéines capables de s'accrocher au génome au niveau de zones promotrices, situées juste avant le gène. Ils sont spécifiques seulement de certains promoteurs, d'ou spécificité au niveau des gènes exprimés. Ainsi, une fois les facteurs de transcription liés aux promoteurs, ils permettent a la machinerie de transcription de se mettre en route et de produire les arn messagers voulus
2/ Régulation épigénétique
Certaines protéines dites "epigénétiques" sont capable de "compacter" ou "décompacter" certaines parties du génome, et en particulier les promoteurs. Ainsi, si un promoteur est compacté, il n'est plus accessible aux facteurs de transcription qui ne peuvent plus guider la machinerie transcriptionnelle.
Pour imager, chaque plan de la bibliothèque (gène) est fourni avec un post-it (promoteur) ou est ecrit dans quelles circonstances la photocopie du plan devra avoir lieu. Des types sont la pour lire les post-it (facteurs de transcription), et en fonction de ce qu'il y a d'ecrit, de faire photocopier (par la machinerie de transcription) les plans en copies "utilisables" (les arn messagers). En plus de ca, il y a d'autres types qui sont responsables de chiffonner le post-it (les facteurs épigénétiques) pour qu'ils soient illisibles.

Je pourrais continuer sur ma lancée avec la suite, les régulations post-transcriptionnelles , traductionnelles et post-traductionnelles, mais comme tu dois commencer a t'en rendre compte, y'a du monde qui passe avant que ton engin de chantier soit construit, et utilisé...

[MaliciaR]

Bonjour,

Certaines protéines dites "epigénétiques" sont capable de "compacter" ou "décompacter" certaines parties du génome, et en particulier les promoteurs. Ainsi, si un promoteur est compacté, il n'est plus accessible aux facteurs de transcription qui ne peuvent plus guider la machinerie transcriptionnelle.

Pourrais-tu préciser ce passage? Je n'ai jamais entendu parler d'un "promoteur compacté" Ni de protéine "épigénétiques" (je pinaille peut-être ) : de la régulation épigénétique, oui, des protéines dont l'action résulte en ça, oui aussi, mais that's all


Cordialement,

[mnafati]

Bonjour,



Pourrais-tu préciser ce passage? Je n'ai jamais entendu parler d'un "promoteur compacté" Ni de protéine "épigénétiques" (je pinaille peut-être ) : de la régulation épigénétique, oui, des protéines dont l'action résulte en ça, oui aussi, mais that's all


Cordialement,

En effet^^, je fais quelques abus de langage... mais parler d'histones déacétylases, de méthyltransférases et autres polycombs n'aiderait certainement pas a la vulgarisation du discours non plus. Quant à l'adn, la aussi tu as raison, on parle plutot d'adn condensé (hétérochromatine) ou décondensé (euchromatine), la je n'ai pas d'excuse, ca m'apprendra a faire le malin et a ecrire vite et sans me relire

[mnafati]

Après un rapide coup d'oeil, il semble bien que l'on puisse parler d'adn compacté, aussi bien en anglais qu'en francais (recherche rapide sur pubmed). Quant a savoir si tu pinaille, oui, mais a mon corps défendant je dois admettre que tu a absolument raison de le faire, et que le terme "pinailler" n'est pas approprié. Je pense que je remercierai des gens comme toi le jour ou je soutiendrai ma thèse^^

[piwi]

Je ne sais pas si il y a lieu de pinailler pourtant. Parler de promoteur compacté ne me semble même pas si abusif que cela. Le terme renvoie bien au rôle des histones (méthylation par exemple) et l'idée de condensation de la chromatine empêchant l'accessibilité au promoteur des protéines promouvant la transcription. Personnellement quand tu as utilisé le terme mon cœur n'a pas fait un bond, même pas un froissement de sourcil, rien! Le terme est peut être à justifier pour qui ne connait pas bien les mécanismes qu'il sous-entend mais n'appelle certainement pas des excuses.

Rien n'est gravé dans le marbre. L'important quand on choisi ses mots et de bien le faire et de pouvoir le justifier. Si vous le pouvez alors il n'y a pas le moindre souci. A un certain niveau, il faut se sentir libre avec les notions et les concepts. Vous auriez pu appeler cela une tarte au fraise, si vous aviez réussi à me convaincre que le terme était approprié alors je n'aurais rien redit non plus.

Cordialement,
piwi

[Zellus]

Oui ADN compacté ça existe. C'est promoteur compacté qui fait bizarre. Mais comme un promoteur est un morceau d'ADN, on peut sans doute le dire aussi. Par contre protéine épigénétique ...

[mnafati]

Pour etre honnete, je n'en ai pas la moindre idée pour ce qui est de parler de promoteur compacté ou pas... Toujours est il que l'adn peut etre différentiellement marqué de facon globale (comme on le voit en microscopie entre zones sombres et claires), mais aussi bien plus finement. Par exemple, les marques épigénétiques se trouvent plus fréquement au niveau des promoteurs et/ou en plein centre des orfs (auquel cas on leur attribut un role dans la régulation "fine" de la vitesse de transcription d'un gène), tant est si bien qu'à y regarder plus finement on peut sans doute considérer au niveau d'un gène donné des zones plus condensées que d'autres. Je ne suis cependant pas spécialiste du sujet... il y a un épigénéticien dans le coin?