analyse gène

[invite2bdabc31]

bonjour
on me demande d'analyser une séquence d'un gène d'une espèce bactérienne et de repérer ses promoteur et ribosomes bindings site?

comment faire? j'y me me connais pas trop! svp aider moi!
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[IngDr]

Est ce dans le cadre d'un exo, d'un TP, d'un projet de recherche ?

[invite2bdabc31]

Est ce dans le cadre d'un exo, d'un TP, d'un projet de recherche ?

c'est un atelier TP et un exo de bio info et comme je suis pas spcialiste dans le domaine bio mol et génomique ni la bioinfo je nage! koi!

[invite77749503]

Si tu a la séquence ,je suppose,
sans ta séquence tu ne peux rien faire, donc il y a les sites comme ncbi, expasy où tu peux trouver toutes tes réponses.

[A voir en vidéo sur Futura]

[invite77749503]

Et si tu as ta séquence tu peux trouver le RBS et le site renfermant le promoteur.

Chez les bactéries l'initiation de la traduction se fait après association du ribosome avec une région contenant un site de fixation pour la petite sous unité du ribosome. Cette région (Ribosome Binding Site ou RBS) renferme une séquence complémentaire de l'extrémité 5' de l'ARN 16S (le Shine-Dalgarno: 5'-AAGGAGGTG-3'). Cette séquence contient généralement le motif GGAGG situé à 6 ou 11 bases du codon initiateur (des distances plus grandes ou plus petites ont été observées).