Prédiction de coupure d'un génome par des enzymes de restriction

[invite853321bf]

Bonjour,
Je me tourne vers la communauté pour savoir si l'un d'entre vous connait un site permettant de prédire le nombre de coupures d'un génome entier de bactéries (4Mb) par des enzymes de resctrictions.
J'ai essayé NEBcutter V2.0 http://tools.neb.com/NEBcutter2/
Malheureusement il ne permet de tester "que" sur des séquences de 300kb.
Si quelqu'un connait un site ou un programme sans restriction de taille, merci d'avance
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[piwi]

Webcutter 2.0 te fera ton boulot ^_^

http://rna.lundberg.gu.se/cutter2/

Cordialement,
piwi

[invite853321bf]

Merci beaucoup pour cette réponse rapide, je vais tester.
j'en profite pour présenter http://insilico.ehu.es/digest/
Un peu moins flexible quand au choix des génomes ou séquence et dans le choix des enzymes mais remplit bien son rôle, il m'a donné un début de réponse

[invite853321bf]

Je viens de tester Webcutter, il n'arrive pas à utiliser le numéro d'accès Genbank de mon génome. Ca risque d'être compliqué de tester gène par gène sans parler de l'interprétation des résultats . Merci quand même, je le garde pour les gènes, il est vraiment complet à ce niveau là

[A voir en vidéo sur Futura]