Les acide aminés

[smimi]

salut
j'ai un exercice de biochimie un peu difficile ,
et l'énoncé est le suivant:
on considère un pentapeptide "P" constitué de cinq résidus d'acides aminés.l'hydrolyse acide de "P" par HCl 6N suivie d'une chromatographie révèle une composition brute en acide aminés: Ala, Glu,Gly,Lys et met.
1.l'action de la carboxypeptidase sur "P" libére la glycine.
2. la digestion de "P" par la trypsine donne un acide aminé libre et un tetrapeptide " A".
3.le traitement de "P" par le bromure de cyanogéne (Br-CN) donne naissance à deux peptides (un dipeptide et un tripeptide). Lorsque ces deux peptides sont soumis à une électrophorèse à PH=7, le dipeptide migre vers l'anode alors que le tripeptide migre vers la cathode.
-interpréter les résultats de chaque étape expérimentale.
-donner la séquence du pentapeptide.
un peu d'aide ..et merci
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[invitec14ae906]

Bonsoir, j'imagine que les enzymes utilisées doivent couper entre deux AA particuliers ou bien si un AA est au bout du peptide.

Ta question ressemble plutôt à de la biochimie, je ne suis pas sûr que tu ais posté dans la meilleure partie du forum.

[smimi]

oui je sais c'est ma faute..
en tous cas merci pour votre aide

[Colbec]

Bonjour,
- la carboxypeptidase coupe l'extrémité C-terminal du peptide.
- la trypsine coupe la liaison peptidique impliquant le carboxyle (C=O) des acides aminés basiques.
- le bromure de cyanogène permet de cliver le peptide au niveau de la Met.

[A voir en vidéo sur Futura]

[AstroBax]

Salut,

Nous exigeons absolument que le demandeur montre qu'il a réfléchi à son problème. Chaque question doit être accompagnée d'une piste ou d'un raisonnement.

cf. A lire avant de demander de l'aide pour un exercice

Dis-nous ce que tu en penses, qu'est-ce que tu arrives à déduire de ces informations, et après on t'aiguilleras
Mais on est pas là pour faire les exos à ta place...

[Edelweiss68]

Bonsoir,

D'autant plus que les exercices se postent dans la rubriques "exercices de biologie" du forum!

[LXR]

Merci de faire attention à l'organisation du forum. Même remarque qu'Edelweiss.

LXR pour la modération

[smimi]

ok
d'après mes connaissances la carboxydase coupe l'extrémité des chaines polypeptidiques en se fixant sur les acides amines terminaux donc on va obtenir NH2-AA1-AA2-AA3-AA4-gly-COOH
n'est ce pas??
et la trypsine hydrolyse les liaisons peptidiques du coté C-terminal
donc on va obtenir: NH2-AA1-AA2-AA3-lys-gly-COOH
et puisque le bromure de cyanogéne réagit spécifiquement avec la méthionine,et dans l'exercice il nous indique que le traitement de "p" avec le BrCN donne naissance à un dipepetide et un tripeptide donc:
NH2-AA1-Met-AA3-lys-gly-COOH
mais où je dois placé Ala et Glu et pourquoi on a soumis ces deux peptides à une électrophorèse ?!
c'est mon raisonnement je ne sais pas est ce que je suis correcte ou non alors un peu d'aide s'il vous plait et je serai très reconnaissante.
et merci d'avance

[smimi]

###### suppression de la partie en doublon. JPL, modérateur

bon mon raisonnement est le suivant:
d'après mes connaissances la carboxydase coupe l'extrémité des chaines polypeptidiques en se fixant sur les acides amines terminaux donc on va obtenir NH2-AA1-AA2-AA3-AA4-gly-COOH
n'est ce pas??
et la trypsine hydrolyse les liaisons peptidiques du coté C-terminal
donc on va obtenir: NH2-AA1-AA2-AA3-lys-gly-COOH
et puisque le bromure de cyanogéne réagit spécifiquement avec la méthionine,et dans l'exercice il nous indique que le traitement de "p" avec le BrCN donne naissance à un dipepetide et un tripeptide donc:
NH2-AA1-Met-AA3-lys-gly-COOH
mais où je dois placé Ala et Glu et pourquoi on a soumis ces deux peptides à une électrophorèse ?!
je ne sais pas est ce que je suis correcte ou non alors un peu d'aide s'il vous plait et je serai très reconnaissante.
et merci d'avance

[smimi]

désolé
mais vous avez demander un raisonnement ou une explication alors
j'ai écris ce que j'ai pensé..

[JPL]

Fusion de trois discussions et suppression des doublons.

[AstroBax]

Bonsoir, ou bonne nuit, selon ou vous en êtes dans votre cycle de sommeil

d'abord, désolé de ne pas avoir répondu plus tôt mais je n'ai plus beaucoup passé sur le forum ces derniers jours.

Alors nous y voilà:
Ta première conclusion au sujet de G est correcte, ton peptide finira bien par G.
Pour la 2e info, la trypsine va couper en C-ter de K ou R, vu qu'on a pas de R ici, ça simplifie le problème. De plus on te dit que ce clivage va produire un monopeptide et un tetra peptide, ça nous laisse 2 choix:
???KG ou K???G (et là, je comprend pas très bien leur notion de "tetrapeptide en " A"" alors j'en sais pas plus, mais là 2ème solution me paraît plus juste...).
Puis on te parle de bromure de cyanogène, qui va cliver en C-ter de M et produire un dipeptide et un tetrapeptide, donc M est forcément en position 2 ou 3.
Pour la dernière touche, je te laisse réfléchir, mais rappelle-toi que dans un électrophorèse, les peptides vont migrer selon leur charge totale, réfléchit à quels acides aminés sont chargés à pH 7 (a.a acides ou basiques) et tu devrais pouvoir en conclure la position exacte de M, ainsi que celle de A et E...

Dis-moi si ça ne va pas...
Cordialement,

Astro

[smimi]

bon,normalement c'est très claire:
je pense que puisque le dipeptide à PH=7 migre vers l'anode donc il est un anion donc DP est de charge (-) alors: PH de DP est < PH= 7 ce qui nous permet de conclure que DP contient le Glu , donc il est en position 2 ou 3..ici on peut dire que la Met est en position 3, donc le Glu est N° 2
et pour le tripeptide à PH=7 migre vers le cathode il est un cation donc TP est de charge (+) Donc il est en position 4 dans la chaine d'AA...
alors la séquence du pentapeptide est la suivante:
NH2-Glu-Met-Ala-Lys-Gly-COOH.
n'est ce pas??

[smimi]

j'ai oublié de mettre que puisque TP de charge (+) alors Ala est en position 4

[AstroBax]

Au final, tu obtiens NH2-Glu-Met-Ala-Lys-Gly-COOH, oui, ça m'a l'air bon, mais si tu prend ma deuxième solution ( qui part de Lys-?-?-?-Gly), tu arrives aussi à faire quelque chose qui fonctionne je crois: c'est Lys-Ala-Met-Glu-Gly
Mais tu as compris ce qu'il voulait dire par "donne un acide aminé libre et un tetrapeptide " A" " ?

oui, bon, je sais, c'est pas moi qui pose les questions...

Cordialement,
Astro