RFLP, SNP et compagnie !
Bonsoir à tous,
j'ai plusieurs questions sur les marqueurs utilisés en génomique...
Comme par exemple SNP et RFLP et microsat etc..
D'abord par exemple les SNP: ce sont des séquences qui se trouvent ""physiologiquement"" dans l'ADN, c'est bien ça ?? les RFLP je sais pas !
Mais comment ils sont utilisés comme des marqueurs ??? quel est le principe, briévement svp !!!
Merci beaucoup
Personne pour me répondre ?!!
salut =)
alors déjà, les SNP sont des RFLP. Ce sont des polymorphismes (une mutation d'un ou de plusieurs nucléotides en gros) non pathologiques. Ils se situent dans la plus part des cas dans un intron.
on peut les utiliser pour découvrir un gène (enfin maintenant c'est plus trop utilisé du fait qu'on a séquencé tout le génome ^^), pour effectuer un test de paternité ou alors pour voir quel est l'allèle pathologique dans le cas d'un sujet hétérozygote pour une maladie ...
Oui justement, j'arrive pas à comprendre le principe par exemple pour le 3éme cas que vous avez cité (Détrminer l'alléle responsable d'une maladie ), je comprends pas COMMENT ?????
Bonjour,
Non, les SNP ne sont pas forcément des RFLP. Par définition, les SNP sont des polymorphismes d'un seul nucléotide. Cela dit, les SNP peuvent être à l'origine des RFLP, mais pas toujours.Envoyé par darkorrr
H u m a n i t y
Vous en avez un exemple à la fin de cette page : http://www.edu.upmc.fr/sdv/masselot_...hisme/snp.html.
Si la mutation présente dans la maladie modifie également un fragment de restriction, en analysant les différents fragments obtenus après digestion par l'enzyme de restriction, vous pouvez d'une part savoir si l'individu a son site de restriction muté et d'autre part si il est hétérozygote ou homozygote pour le gène en question.
H u m a n i t y
Oui exact, autant pour moi. J'ai écrit trop vite ma réponse ... ^^. Mais pour une étude d'un gène ou maladie on utilisera plus fréquement les SNP qui forment un RFLP non? Comme ça, après avec PCR on peut "facilement" étudier ces polymorphisme et savoir si ils sont hétérozygote ou non pour un individu.
En fait ayant une connaissance assez faible de la biologie moléculaire, je ne connais que cette méthode
On utilisera les SNP pour analyser la maladie, si cette maladie est due à des SNP clairement identifiés.
Sinon, la HRM Analysis se développe de plus en plus pour analyser les SNP et avec des résultats intéressants à ce qu'il parait
http://www.gene-quantification.de/hrm.html
