Epissage alternatif

[invitecd95e636]

Bonsoir,

L’épissage alternatif permet à partir d'une séquence (contenant des introns et des exons) d'avoir des protéines différentes or, je ne comprend pas en fonction de quoi l'exon X va pouvoir se mettre avec l'exon Y et pas avec l'exon Z

Un exemple :
séquence : Exon1-Intron1-Exon2-Intron2-Exon3-Intron3-Exon4
(Je précise que l'exon 1 comprend un codon start en première position et l'exon 4 à un codon stop en dernière positon)
L'épissage alternatif peut nous donner 3séquences:
1) Exon1-Exon2-Exon3-Exon4
2) Exon1-Exon4
3) Exon1-Exon3

Pourquoi l'épissage alternatif ne peut pas donner d'autre séquences ( comme Exon1-Exon2-Exon4 par exemple) ?

Merci d'avance pour votre aide
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[invitedcfa2657]

Bonjour,

Comme pour la transcription l'épissage est régulé par des protéines.
> Les splicing silencers sont des sites sur lesquels vont se lier des répresseurs d'épissage protéiques ce qui réduira la probabilité qu'un site d'épissage proche soit utilisé.
> Les splicing enhancers sont des sites sur lesquels vont se lier des activateurs d'épissage protéiques ce qui augmentera la probabilité qu'un site d'épissage proche soit utilisé.

Donc théoriquement, se dire qu'avec la séquence qu'on vous donne seuls trois épissages sont possibles, c'est faux: votre proposition est tout à fait possible MAIS dans la réalité, certains épissages seront favorisés, d'autres impossibles, etc.

Donc à moins qu'on vous ait donné plus d'informations sur les exons en questions et d'éventuels splicing signals, il est concevable que Exon1-Exon2-Exon4 soit possible. A noter que parfois, il peut même y avoir conservation d'introns notamment au niveau de l'épissage de rétrotransposon (typiquement, les éléments P autonomes chez la drosophile)

Cordialement, et bonne fin d'année !

[invitecd95e636]

Tout d'abord merci pour votre réponse.
Comme information en plus j'ai la séquence en nucléotides des exons et des introns mais rien d'autre.

Cordialement,

p.s : Bonne fin d'année a vous aussi !