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PCR amorce sens et anti sens



  1. #1
    angelique9122

    PCR amorce sens et anti sens


    ------

    Bonjour, je m'emmêle les crayons avec les amorces sens et anti sens... Est ce que l'amorce sens se fixe bien sur le brin d'ADN anti sens donc 3'-5' ? et l'amorce anti sens se fixe sur le brin d'ADN sens (5'-3') ?

    Dans ce cas si j'ai :

    5' ATGGCTGCTGAGGC .... GCCCGTAAAGCGCGC 3'

    Mon amorce sens sera par exemple : 5' ATGGCTGCTG 3'

    Par contre mon amorce anti sens qu'elle sera-t-elle? Doit-elle être exprimé dans le sens 3' - 5' ou dans le sens 5' - 3' ?

    Je patauge complétement pour cette histoire d'amorce anti sens si quelqu'un pourrait m'éclairer ce serait vraiment très gentil
    Merci d'avance

    -----

  2. #2
    Aqualung

    Re : PCR amorce sens et anti sens

    Tout d'abord les amorces, en tant que séquence nucléotidiques s'expriment en 5'-3'.

    L'amorce dite "sens" est celle qui se lira dans le bon ordre lorsqu'elle est placée sur le brin. Donc en effet elle se place sur le brin antisens. A l'inverse l'amorce antisens est placée sur le brin sens. Une fois que tu as la séquence à hybridée n'oublie pas d'inverser l'ordre des nucléotides afin de lire la séquence de 5' en 3'.


    Pour reprendre ton exemple :

    Brin Sens 5' ATGGCTGCTGAGGC .... GCCCGTAAAGCGCGC 3'

    Brin Antisens 3' TACCGACGACTCCG ... CGGGCATTTCGCGCG 5'

    -->

    Brin Sens 5' ATGGCTGCTGAGGC .... GCCCGTAAAGCGCGC 3'
    .............................. .............................. ...... TCGCGCG (Antisens)

    ...................... ATGGCTG (sens)
    Brin Antisens 3' TACCGACGACTCCG ... CGGGCATTTCGCGCG 5'

    Amorce sens : ATGGCTG
    Amorce Antisens : GCGCGCT
    Dernière modification par Aqualung ; 04/12/2012 à 22h19.

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