Bonjour,
J'aimerai connaître votre avis.
Je regarde l'expression de deux gènes + gène de ménage dans des cellules ayant des traitements différents.
Grâce au calcul de quantification relative à l'aide du deltadelta Ct, je connais l'expression de chacun de ces gènes pour les différents traitements (j'ai posé un traitement de référence).
Toutefois, même si cette information est très intéressante, il est nécessaire pour le projet de calculer un ratio entre l'expression des deux gènes. Certains traitements favorisent l'augmentation du ratio (donc l'expression plus forte du gène 1 par rapport au gène 2 dans notre cas).
J'ai donc choisi d'utiliser une autre méthode de calcul avec correction d'efficacité:
QR gène1=Efficacité primer1 ^-Ctgène1/Efficacité primerref ^-Ctgèneref
J'ai fait le même calcul pour le gène 2.
Ai-je le droit mathématiquement parlant et biologiquement parlant, de poser et calculer le ratio QR gène1/QR gène 2 pour chaque traitement?
Merci d'avance pour votre réponse,
(rapide si possible)
Cloclo
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