Caractère acide ou basique des acides aminés

[invite1714aeae]

Bonjour,
je ne comprends pas pourquoi on appelle acide un acide aminé avec un pHi faible et basique un acide aminé avec un pHi élevé, pour moi si le pHi est faible l'acide aminé sera majoritairement sous forme basique...
Merci beaucoup !
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[Loupsio]

Bonjour,
Acide et basique se réfère à la facilité avec laquelle la molécule libèrera son proton (H+)
Un milieu acide est un milieu riche en H+ libres,
si tu libère des H+ tu acidifie ton milieu
Donc si ton acide aminé àun pHi faible, cela veut dire qu'il libèrera facilement son H+ et ce qui a pour conséquence d'acidifier le milieu, c'est donc un acide aminé "acide"
A l'inverse une molécule qui à un pHi élevé, va plutôt avoir tendance à capter les protons et donc rendre le milieu moins acide puisqu'il libèrera son proton à des pH de 10-12 pour les acides aminés tels que la lysine et l'arginine (on parle donc d'acide aminé basique)

[invite2eb5a45f]

Attention, il est impropre de parler de pHi pour décrire le caractère acide ou basique des fonctions d'un acide aminé, on y préfèrera la notion de pKa.

Le pHi ne concerne pas une fonction en particulier (il est donc impropre de parler de caractère acide ou basique sur la base du pHi). Elle concerne avant tout l'acide aminé sous forme libre car sous forme de résidu, une seule charge est éventuellement porté par l'acide en aminé, et la notion de pKa suffit à décrire cet état (en revanche le pHi peut être utilisé pour parler de la protéine dans son ensemble). La notion de pHi permet de décrire le comportement électrique de l'acide aminé résultant de l'état dans lequel se trouve les fonctions amines et acides carboxyliques (et éventuellement d'une troisième fonction sur la chaine latérale), de telle sorte que le pHi est la moyenne des pKa pour ce genre d'acide aminé. A pH=pHi, l'acide aminé est statistiquement sans charge électrique.

Preuve qu'il faut bannir cet usage, vous avez parlé d'"acide aminé [...] sous forme basique". Ça ne veut rien dire.

Sinon cet article est assez clair : https://en.wikipedia.org/wiki/Isoelectric_point