Identification des bactéries

[invite91147211]

Bonjour, je suis étudiante en microbiologie et actuellement en stage.
J'ai une question sur l'identification des bactéries.
Dans les résultats de séquençage, nous savons que nous avons des Chromohalobacter.
Par contre, nous ne savons pas quelle espèce de Chromohalobacter nous avons entre C. israelensis, C.salexigen ou C.marismortui.
Il faudrait donc trouver une séquence d’ADN qui nous permettrai de savoir à quelle espèce cette bactérie appartient.
Pourriez-vous m'aider à trouver comment faire.
Je vous en remercie par avance
Violoncelle

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[invite9dc7b526]

Je commencerais par regarder la littérature, et d'abord les publis où ces espèces ont été décrites. S'il n'y est pas question de génétique (si c'est des publis anciennes), je chercherais sur les bases de données des séquences de ces espèces et essaierais de les blaster pour voir un peu qui s'aligne avec quoi. Avec la sonde qui va bien, il suffit d'une différence d'une paire de bases pour identifier une espèce.

[invite91147211]

Merci beaucoup,
C'est ce que je pense aussi. Je suis rassurée.
C'est parti pour la fouille archéologique du site PubMed;
Connaissez-vous un autre site gratuit pour nous ?
Avec mes remerciements
Bonne soirée
Violoncelle

[invite9dc7b526]

j'ai utilisé ce site : http://bacteria.ensembl.org/index.html

[A voir en vidéo sur Futura]

[invite91147211]

Je vous prie de recevoir mes remerciements
Cordialement
Violoncelle