bonjour à tous,
connaitriez vous des sites qui permettent d'avoir les cartes de plasmide, afin de connaitre les enzymes de restriction ainsi que la taille des plasmides...pour ceux qui n'ont pas DNA strider.
bonne soirée
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carte de plasmide
- 14/08/2006, 21h32 #1inviteb38fc7ba
carte de plasmide
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- 14/08/2006, 21h37 #2invitec9f0f895
Re : carte de plasmide
salut
Oui en voici un tres bien : http://tools.neb.com/NEBcutter2/index.php
il permet de tout faire.
Yoyo
- 14/08/2006, 21h45 #3inviteb38fc7ba
Re : carte de plasmide
malheureusement les 2 plasmides qui m'interessent ne sont pas dans la liste
- 14/08/2006, 21h52 #4invitec9f0f895
Re : carte de plasmide
ah zut, désolé j'avais mal compris ta question!
Je croyais que tu cherchais un logiciel permettant de visualiser un plasmide a partir de sa sequence d'ADN.
Malheureusement il n'existe pas de base de données pour les plasmides. mais c'est quoi le nom de tes plasmides ?
Yoyo
- Aujourd'huiA voir en vidéo sur Futura
- 14/08/2006, 22h09 #5inviteb38fc7ba
Re : carte de plasmide
ce que je recherche c'est la carte de restriction de plasmide...pRS425 et pAE30
- 15/08/2006, 02h33 #6invitec9f0f895
Re : carte de plasmide
J'ai rien trouvé pour le pAE30, en revanche voici la sequence du pRS425, tu n'as plus qu'a la copié/collé dans le site que je te donnais dans mon message 2 et tu auras ta carte de restriction (a moins que tu n'es strider).
Yoyo
D'apres ce lien: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/v...ide&val=416323
Envoyé par pRS425 sequence
YOyo
- 16/08/2006, 10h18 #7inviteb38fc7ba
Re : carte de plasmide
merci yoyo
- 16/08/2006, 10h38 #8inviteb753ced1
Re : carte de plasmide
Yo Envoyé par vanessa25 
J'ai trouvé un article décrivant la mise au point du plasmide pAE30 : il résulte apparemment d'une succession de sous-clonages via différents vecteurs...faudra faire des petits calculs pour retrouver la séquence finale !
Lien de l'article ici (in english)
a+
- 21/08/2006, 16h35 #9Jean-Luc P
Re : carte de plasmide
Juste histoire de faire de la pub pour un beerware bien sympa sur PC :
pDRAW32 est un utilitaire de design de plasmides bien sympa. http://www.acaclone.com/
Snon APe http://www.biology.utah.edu/jorgensen/wayned/ape/ se défend aussi.Jean-Luc
La violence est le dernier refuge de l'incompétence.
Salvor Hardin
- 21/08/2006, 16h45 #10inviteb753ced1
Re : carte de plasmide
Envoyé par Jean-Luc P
Yes je confirme !!!
Je l'utilise depuis plusieurs années, et il est vraiment facile de prise en main (comme d'autres choses). Bref, on peut designer des plasmides, faire des cartes de restriction avec une enzyme ou un lot d'enzymes, définition d'amorces PCR, etc.
pDRAW32 est vraiment top pour gérer (sans prise de tête) ses constructions...en plus il est beerware (contrairement à d'autres logiciels, certes plus perfectionnés, mais très chers...)
tchuussssssss
- 21/08/2006, 17h08 #11invite84b0382c
Re : carte de plasmide
pRS425:
http://www.atcc.org/common/images/ve...gifs/77106.gif
pas trouvé pour l'autre
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