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A partir de quelle valeur de Ph est élué un peptide



  1. #1
    Marceline21

    A partir de quelle valeur de Ph est élué un peptide


    ------

    Bonjour je suis bloquée sur le meme type d'exercice tout le temps .

    Cest pour calculé la charge d'un peptide et donc à partir de quand est il élué


    Par exemple pour l'exercice ci contre

    le peptide est PACES

    Nom : Snapshot_20141212.JPG
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    la colonne est échangeuse de cation donc négative donc le peptide doit etre negatif pour etre élué mais je suis bloquée.
    dans l 'exercice c'est aussi indiqué que la gamme de ph commence à ph1
    pouvez vous m expliquer la demarche à suivre svp

    Merci d avance

    -----

  2. #2
    HarleyApril
    Modérateur

    Re : A partir de quelle valeur de Ph est élué un peptide

    Bonsoir

    Dans un premier temps, il faut repérer les acides aminés qui composent le peptide (je suppose que tu sais faire).
    En milieu acide l'amine N-term (Pro) est protonnée, l'acide C-term (Ser) aussi et l'acide du Glu aussi.
    Quand on augmente le pH, une de ces fonctions va être déprotonnée, le peptide sera donc neutre et commencera à se détacher.
    Qui va être déprotonné en premier ?
    Réponse dans la table de pK !

    Pour moi, c'est quand le peptide est neutre qu'il commence à être élué. Cependant, si dans ton cours on dit que c'est quand il est anionique qu'il est élué, il te faut chercher qui sera déprotonné en deuxième.

    Cordialement

  3. #3
    Marceline21

    Re : A partir de quelle valeur de Ph est élué un peptide

    Bonsoir

    jai appris qu'il existait comme AA ionisable DERCHKY DECY acide HKR basique

    en milieu acide si jai pris compris jai

    NH3+ -P-A-C-E-S-COOH ?

    A est non ionisable donc charge nul ?


    jai donc a ph acide NH3+ 0 COOH COOH COOH = charge globale + 1 je veux une charge de 0


    soit NH3+ doit passer en NH2 cest à dire au pka 2 de la proline soit 9,6

    soit COOH de la Cysteine passe en COO- au pkr 8,3

    soit COOH de l acide glutamique passe en COO- au pkr 4,3

    Soit COOH de la serine passe au COO- au pka1 2,2

    la premier pka atteint sera donc celui de la Serine donc reponse D _ 2,3 ? ils ont rajoutés 0,1 pour etre "moin zwitterion et se rapproché vers une valeur négative" ?

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