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bcp de questions sur RMN



  1. #1
    lisiquo

    bcp de questions sur RMN

    Bonjour,
    Je commence juste la RMN et je ne comprends pas grand chose. Dans mon labo, ils parlent de "line broad" qu'est ce que ca represente ? pourquoi faut-il changer leur valeur ? pourquoi d'une experience a l'autre leur valeur n'est pas la meme (d'une 1D experience a 2D par exemple).
    Ensuite, il semble exister differentes methodes pour eliminer le signal de l'eau, quelles sont les principales ? Comment marche celle appelee watergate ?

    Qu'est-ce qu'un "filtre T2" et un filtre "spin lock" ? A quoi cela sert-il ?

    Enfin, est-ce quelqu'un connait une methode appelee "slice selective " basee sur un gradient pour obtenir 2 spectres differents pour chaque compartiment d'un tube place dans le spectrometer ?
    Aller, une derniere pour la route, comment passe-t-on d'un spectre 2D a un spectre 1D ?
    Merci bcp bcp bcp d'avance

    -----


  2. #2
    CoucouHibou

    Re : bcp de questions sur RMN

    Salut,

    Alors avant de me lancer dans des explications, si tu as du mal avec la RMN, un bouquin qui s'appelle "Spin Dynamics" de M.H. Levitt va beaucoup t'aider.

    Ensuite, point par point :

    - Line broadening ça veut dire élargissement de raie : c'est un procédé de traitement de la FID. Lorsqu'elle est tronquée (pas acquise jusqu'au bout de la relaxation T2) ou pleine de bruit, on multiplie ce signal par une fonction qui tend vers 0. Plus ça va vite vers 0, plus ça élargit les raies, mais moins tu as de problèmes de bruit et de troncature.

    Dans les XP en 2D, tu dois souvent tronquer la FID dans la dimension indirecte, d'où un LB différent que celui dans la dimension directe.

    - pour éliminer l'eau, la méthode la plus simple consiste à irradier l'échantillon à très faible puissance pile à la fréquence de l'eau juste avant ta séquence d'impulsion. Dans ce cas tu égalises les populations up et down des spins de l'eau.

    - les filtres T2 et spin lock servent à éliminer des cohérences non désirées. Il s'agit de privilégier certains spins en les faisant relaxer plus lentement que d'autre (noublies pas qu'en général, T1 > T2) en les alignant avec B0 (T2 filter ou z filter) ou avec B1 (spin lock).

    - la méthode slice sélective consiste à exciter seulement une tranche de ton échantillon. Pour ce faire tu le places dans un gradient de champ magnétique, et tu l'excite avec une impulsion très sélective (sécante hyperbolique par ex.). Ensuite tu enlèves le gradient avant l'acquisition.

    - pour passer d'une 2D à une 1D ? Pour quoi faire ? il suffit de sélectionner une ligne ou une colonne sur la 2D a priori (ça se fait bien avec topspin et xwinnmr, par contre vnmr... Je sais pas trop...)... Ou alors de faire la transformée de Fourier dans une seule des deux dimensions...

    Voilà, bon courage,

    Hibou

  3. #3
    lisiquo

    Re : bcp de questions sur RMN

    - Line broadening ça veut dire élargissement de raie : c'est un procédé de traitement de la FID. Lorsqu'elle est tronquée (pas acquise jusqu'au bout de la relaxation T2) ou pleine de bruit, on multiplie ce signal par une fonction qui tend vers 0. Plus ça va vite vers 0, plus ça élargit les raies, mais moins tu as de problèmes de bruit et de troncature.

    Dans les XP en 2D, tu dois souvent tronquer la FID dans la dimension indirecte, d'où un LB différent que celui dans la dimension directe.

    OK, c'est plus clair. Y a t-il un moyer pour determiner un LB pour pouvoir comparer une experience 2D avec une 1D ?

    - pour éliminer l'eau, la méthode la plus simple consiste à irradier l'échantillon à très faible puissance pile à la fréquence de l'eau juste avant ta séquence d'impulsion. Dans ce cas tu égalises les populations up et down des spins de l'eau.

    est-ce que c'est ce qu'on appelle la presaturation ? comment se fait-il que le signal de l'eau ne reapparaisse pas pendant l'experience, il n'y a pas de phenomene de relaxation ?

    - les filtres T2 et spin lock servent à éliminer des cohérences non désirées. Il s'agit de privilégier certains spins en les faisant relaxer plus lentement que d'autre (noublies pas qu'en général, T1 > T2) en les alignant avec B0 (T2 filter ou z filter) ou avec B1 (spin lock).

    Merci bcp pour ton aide

  4. #4
    CoucouHibou

    Re : bcp de questions sur RMN

    Salut,

    OK, c'est plus clair. Y a t-il un moyer pour determiner un LB pour pouvoir comparer une experience 2D avec une 1D ?
    en règle générale, quand tu compares des 1D avec des 2D, tu utilises la dimension directe de ton spectre 2D. Dans ce cas, il faut avoir le même LB pour ton spectre 1D que le LB dans la dimension indirecte de ton spectre 2D.

    est-ce que c'est ce qu'on appelle la presaturation ? comment se fait-il que le signal de l'eau ne reapparaisse pas pendant l'experience, il n'y a pas de phenomene de relaxation ?
    Oui il s'agit bien de présaturation. Pour ce qui est de la réapparition du signal pendant l'expérience, il n'y a à peu près aucun risque : les temps de relaxation de l'eau son très long (de l'ordre de la seconde pour T1 il me semble). Comme tu as égalisé les populations des niveau Zeeman de l'eau par présaturation, tu ne peux pas générer de cohérence sur l'eau, donc pas de signal.

    Cependant dans une 2D (une NOESY par exemple), tu peux avoir un temps d'évolution relativement long, là il peut réapparaître un artefact dû à une relaxation de l'eau pendant le temps d'évolution, qui risque de se voir sur ton spectre. Dans ce cas un cyclage de phase approprié devrait pouvoir l'éliminer.

    Voilà, content d'avoir pu t'aider, bon courage,

    Hibou

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