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[Stat] Modèle de Cox sous R



  1. #1
    Romain-des-Bois

    [Stat] Modèle de Cox sous R


    ------

    Bonjour,

    je souhaiterais obtenir l'estimation de la fonction de Survie - à partir de données biomédicales - grâce au modèle de Cox, et tout ça en utilisant le logiciel R.

    J'ai trouvé ce genre de choses :
    charger :
    Code:
    library("survival")
    puis :
    Code:
    coxph(Surv(Entree,Sortie,NonCensure,type="counting") ~ var1 + var2 + var3 + ...)
    
    ...
    Comme d'habitude, j'ai un tableau de données avec plein de covariables, l'indicateur de censure, et la sortie. (L'entrée sera à 0 pour tous les individus)
    J'imagine que Entree correspond à la variable d'entrée, Sortie idem, NonCensure à la variable censure et var1 etc aux covariables...

    C'est bien ça ?

    Je vous remercie de votre aide

    -----

  2. #2
    invite986312212
    Invité

    Re : [Stat] Modèle de Cox sous R

    salut,

    si tu veux estimer et tracer une courbe de survie, utilise plutôt la fonction "survfit" dans le package "survival".

  3. #3
    Romain-des-Bois

    Re : [Stat] Modèle de Cox sous R

    Citation Envoyé par ambrosio Voir le message
    salut,

    si tu veux estimer et tracer une courbe de survie, utilise plutôt la fonction "survfit" dans le package "survival".
    Bonsoir, et merci de ta réponse !

    En fait, je veux faire deux choses :
    - estimer la fonction de survie avec Kaplan Meier (je ne prends en compte que la censure)
    - estimer les paramètres de Cox et tracer la fonction de survie pour le modèle de Cox (et là je prends en compte la censure et les covariables)

    est-ce que ce que tu me proposes permet de tenir compte des covariables comme dans le modèle de Cox ?

    (je dispose des données sur papier donc je veux savoir précisément où je vais avant de les rentrer sur l'ordi )

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