[Stat] Modèle de Cox sous R

[Romain-des-Bois]

Bonjour,

je souhaiterais obtenir l'estimation de la fonction de Survie - à partir de données biomédicales - grâce au modèle de Cox, et tout ça en utilisant le logiciel R.

J'ai trouvé ce genre de choses :
charger :

library("survival")

puis :

coxph(Surv(Entree,Sortie,NonCensure,type="counting") ~ var1 + var2 + var3 + ...)

...

Comme d'habitude, j'ai un tableau de données avec plein de covariables, l'indicateur de censure, et la sortie. (L'entrée sera à 0 pour tous les individus)
J'imagine que Entree correspond à la variable d'entrée, Sortie idem, NonCensure à la variable censure et var1 etc aux covariables...

C'est bien ça ?

Je vous remercie de votre aide
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[invite986312212]

salut,

si tu veux estimer et tracer une courbe de survie, utilise plutôt la fonction "survfit" dans le package "survival".

[Romain-des-Bois]

salut,

si tu veux estimer et tracer une courbe de survie, utilise plutôt la fonction "survfit" dans le package "survival".

Bonsoir, et merci de ta réponse !

En fait, je veux faire deux choses :
- estimer la fonction de survie avec Kaplan Meier (je ne prends en compte que la censure)
- estimer les paramètres de Cox et tracer la fonction de survie pour le modèle de Cox (et là je prends en compte la censure et les covariables)

est-ce que ce que tu me proposes permet de tenir compte des covariables comme dans le modèle de Cox ?

(je dispose des données sur papier donc je veux savoir précisément où je vais avant de les rentrer sur l'ordi )