Thèse en bioinformatique : besoin de conseils - Page 2
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Thèse en bioinformatique : besoin de conseils



  1. #31
    MissJenny

    Re : Thèse en bioinformatique : besoin de conseils


    ------

    Citation Envoyé par curious Voir le message
    Mon but serait de faire une thèse pour pouvoir postuler à des postes dans le privé (industrie pharma) qui m’intéressent. Les postes de data scientist dans les domaines qui m’intéressent (études cliniques, biostatistiques) demandent une thèse, je dirais autour des 90% des postes que j’ai vu.
    C’est dans ce sens là que je trouve qu’avoir une thèse est un atout.
    tu veux faire des statistiques ou de la bioinformatique? Ca n'est pas du tout la même chose. Fais attention au fait que dans l'industrie pharmaceutique les recruteurs sont exigeants (ils en ont les moyens). Quand ils cherchent à embaucher un statisticien ils vont plutôt le chercher dans les écoles doctorales de statistiques.

    Je le dis ici plus clairement : une thèse passé "à côté d'un emploi d'ingénieur" c'est un peu une thèse au rabais, les gens le savent.

    -----

  2. #32
    grivali

    Re : Thèse en bioinformatique : besoin de conseils

    Citation Envoyé par curious Voir le message
    Mon but serait de faire une thèse pour pouvoir postuler à des postes dans le privé (industrie pharma) qui m’intéressent. Les postes de data scientist dans les domaines qui m’intéressent (études cliniques, biostatistiques) demandent une thèse, je dirais autour des 90% des postes que j’ai vu.
    C’est dans ce sens là que je trouve qu’avoir une thèse est un atout.
    Admettons.


    Je ne pense pas que ce soit courant de faire des études cliniques dans les universités ou même dans le privé pour une thèse, et ayant déjà conclu une étude, je sais que c’est ce qui me passionne, et j’ai envie d’en faire mon métier,
    De quel métier parlez vous exactement ?
    Une activité dans le privé sera très différente de celle en CHU, avec plus de contraintes (le médicament il faut le vendre au bout du compte). Si votre activité actuelle vous passionne (?) vous ne trouverez pas l'équivalent dans une entreprise.

    Une thèse me permettra également de valoriser ces publications et vraiment legitimer et devenir un spécialiste dans ce domaine.
    Là je pense que vous surestimez l'intérêt de la thèse.
    Il y a des tas de gens avec une thèse en sciences du vivant qui rament pour trouver un job en rapport avec leurs compétences, on ne peut pas vraiment dire qu'ils soient reconnus comme spécialistes.
    Se sentir légitime n'a souvent pas grand chose à voir avec les diplômes, c'est plus du registre des émotions.

    Je me demande si vous ne vous sentez pas mal à l'aise dans votre milieu actuel; vous n'êtes "qu'"un ingénieur et c'est les médecins qui dirigent ?
    Une thèse ne changera rien à cet état de fait.
    Partir dans le privé peut être une solution, mais il faut accepter de renoncer à certains aspects qui vous plaisent.

  3. #33
    agitateur

    Re : Thèse en bioinformatique : besoin de conseils

    Si je prends le profil linkedin d'une ancienne camarade de primaire collège lycée, actuellement disons qq chose comme "head of statistic Team" dans un gros et fort connu labo pharma francais , elle a fait....une école de Stat ( la principale, en spécialisation Bio Stat ) et pas de thèse.....

    Oui, comme dit Jenny, il en emmêlage de pinceaux, à plusieurs titres je crois.
    Normalement bosser dans un domaine devrait permettre de la situer dans le détail, et là c'est fragile. Je le dis sans jugement, mais tu manques de "recul" et de maitrise de ton propre secteur, et il est possible que dès tes lettres ça se sente et ça le sera encore plus en entretien.
    Bio info c'est différent de stat ( ou bio stat ), et pas forcément égal au traitement date de masse.

    Attention aussi quand tu dis que tu fais des études cliniques.
    un CHU va participer en simultanée à plusieurs études. Sur chacune le temps est plus ou long, mais par définition sur un faible panel "local". L'étude clinique globale que fait la pharma sur une seul produit, c'est la compilation de pleins d'études à divers endroits. On va dire que globalement, ce qui intéresse le labo pharma, c'est de collecter de la donnée brute propre depuis les CHu par ex. , ensuite l'affaire stat c'est la sienne.

    Ce que tu recherches semble se rapprocher de l'attaché de recherche clinique. Il y a des volets purement médicamenteux ( galénique, législation, etc....) donc forcément un pharma te passera devant. Mais il y a peut être moyen de bosser là dedans en volet stat. Mais là on parle de stat, pas de bio info, le domaine souche n'est plus le même. je rejoins Jenny sur un pb de diagnostic, mais bon, je l'avais flairé et c'est bien pour celà qu'il est utile d'insister dans la discussion. Une thèse d'aide au diagnostic, ça ne me semble pas se rapprocher de l'ARC ( mais peut être je me trompe )

  4. #34
    xMeijex

    Re : Thèse en bioinformatique : besoin de conseils

    J'ai vaguement l'impression que la confusion (ou fluidité) entre bioinformatique et biostatistiques est fréquente dès qu'on parle de big data. Chez les candidats comme chez les employeurs. A tort ou à raison, je ne suis pas capable d'en juger.
    Pour curious : offre d'emploi en mp qui surfe sur cette confusion, pourrait coller avec tes intérêts, et ne demande pas explicitement de thèse

  5. #35
    agitateur

    Re : Thèse en bioinformatique : besoin de conseils

    Citation Envoyé par xMeijex Voir le message
    Chez les candidats comme chez les employeurs.
    Je pense que chez l'employeur, la confusion ne dépassera pas la première lecture du CV.
    C'est la difficulté de lire entre les lignes une annonce.
    MAIS normalement c'est pas une difficulté pour un salarié "expérimenté", les choses se reniflent de loin quand il analyse dans SON secteur. Pour un junior, je conçois que ce soit plus délicat.

    le candidat sera souvent tenté de faire du cherry picking ( en stat c'est mal, c'est trés mal !! ) et de se conforter avec l'illusion que corriger un critère résoudra tout ( exemple au hasard...avoir une thèse ).

  6. #36
    MissJenny

    Re : Thèse en bioinformatique : besoin de conseils

    Citation Envoyé par grivali Voir le message
    Une activité dans le privé sera très différente de celle en CHU, avec plus de contraintes (le médicament il faut le vendre au bout du compte). Si votre activité actuelle vous passionne (?) vous ne trouverez pas l'équivalent dans une entreprise.
    je nuancerais. Les deux mondes sont très liés. Les études cliniques financées par l'industrie pharmaceutique sont généralement conduites dans les hôpitaux.

  7. #37
    curious

    Re : Thèse en bioinformatique : besoin de conseils

    Je pense qu'il y a beaucoup de confusions sur ce dont je parle.
    Des études purement statistiques ne sont clairement pas suffisantes pour faire des biostatistiques car il manque la partie bio, notamment en omiques (génomiques, protéomiques, etc). En clair, je participe à des études pré-cliniques en utilisant les techniques omiques, depuis la construction de pipelines/l'utilisation de pipelines open source jusqu'à l'analyse exploratoire. L'analyse exploratoire consiste à utiliser des outils statistiques pour identifier des biomarqueurs par exemple. Une étude clinique ne concerne pas seulement la mise sur le marché de médicaments mais aussi par exemple d'évaluer un diagnostic, en pré-clinique c'est beaucoup plus large, et j'en cite quelques exemples : identifier des marqueurs de tumeurs, ou évaluer l'effet d'une chimiothérapie ou d'un antibiotique sur le microbiote intestinal.
    Je fais donc avant tout des études pré-cliniques, le terme étude clinique est un abus de language ... Mais ce n'est absolument pas le sujet ...
    Il me semble que concernant l'analyse des données
    Pré-clinique : bioinformaticien/data scientist (PhD ou non)
    Clinique : data manager/biostatisticien (PhD ou non)
    Pour clarifier certaines choses, même si les termes sont bcp plus fluides que ça.

  8. #38
    MissJenny

    Re : Thèse en bioinformatique : besoin de conseils

    ah ok, on y voit plus clair. Du coup je rejoins la phrase de Grivali que je citais plus haut : si ce genre d'étude te passionne, il vaut peut-être mieux que tu restes dans la recherche publique.

    mais tu n'as pas dit quelle était ta formation. Ca compte pour trouver une thèse.

  9. #39
    xMeijex

    Re : Thèse en bioinformatique : besoin de conseils

    il l'a mentionné : polytech Sophia/génie biologique/bioinformatique

  10. #40
    agitateur

    Re : Thèse en bioinformatique : besoin de conseils

    Citation Envoyé par curious Voir le message
    Je fais donc avant tout des études pré-cliniques, le terme étude clinique est un abus de language ... Mais ce n'est absolument pas le sujet ...
    Il me semble que concernant l'analyse des données
    Pré-clinique : bioinformaticien/data scientist (PhD ou non)
    Clinique : data manager/biostatisticien (PhD ou non)
    Pour clarifier certaines choses, même si les termes sont bcp plus fluides que ça.
    Ben si c'est le sujet ! Ce qui écrit en compréhensible est normalement compris par le plus grand nombre.
    Faut pisser de la ligne à plusieurs pour te faire sortir du bois, c'est pénible. Donc tu es en pré-clinique, profil trés "public" en recherche, avec un titre ou une appellation qui est presque secondaire en fait car sans impact sur le quotidien, ce serait ingénieur de recherche, ingénieur d'étude en INSERM ou CNRS ou ce que tu veux.
    Tu en sera plus éloigné dans le privé.
    Tu n'as pas répondu, si tu as candidaté ailleurs et le type de réponse ou de non réponse.

    Relis plus, tu entres en plein dedans ( messages jenny ) la thèse n'a rien changé pour bcp et n'a pas permis d'attraper le poste convoité. Ceci dit, pour ton égo ou autre raison, si tu veux le titre vas y. Mais n'attends pas ce qu'il n'y a pas à attendre.

  11. #41
    MissJenny

    Re : Thèse en bioinformatique : besoin de conseils

    Citation Envoyé par xMeijex Voir le message
    il l'a mentionné : polytech Sophia/génie biologique/bioinformatique
    ah ok. Je pense que si l'objectif de curious est de travailler dans l'industrie (pharma ou biotech) il serait peut-être plus judicieux de rester un an ou deux là où il est (parce qu'à 24 ans je suppose qu'il n'a qu'un an, peut-être deux d'expérience) et ensuite chercher un emploi en se prévalant de cette expérience.

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