TIPE mobilité cyanobactéries votre avis

[invite11356b32]

Bonjour à tous, j'ai besoin de votre avis sur ce qui suit

Dans le cadre de notre TIPE ( BCPST 2 ) nous avons choisi de traiter la mobilité des cyanobactéries.
la problématique ( provisoire ) serait "Comment expliquer la mobilité de cyanobactéries ? " sachant que beaucoup d'entre elles ne possèdent pas de flagelles.
nous allons tenter d'expliquer certains points tels que :
_ les mouvements verticaux ( production d'un mucus dont nous allons tester le rôle avec des enzymes )
_ déplacement par rotation ( par des mesures experimentales )
_deplacement rectiligne ( est ce que quelqu'un saurait si l'on peut se procurer Pseudanabaena ou Microcoleus ? par hasard )
_ tester l'influence de differents paramètres du milieu sur la vitesse de déplacement

Que pensez de tout ça ? ( je suis restée vague en générale pour ne pas tout dévoiler on ne sait jamais ! )

j'ai quelques petites questions par contre
_concernant le milieu de culture des cyanobacteries chaque cyanobacterie a t-elle un milieu de culture spécifique ou ce milieu de culture est globalement de même pour toutes ? on pense utiliser Oscillatoria mais reste le problème du milieu de culture étant donné qu'il est possible d'en commander au lycée je ne sais pas trop si ça irait

_ Pour mesurer le déplacement des cyanobacteries on pense le faire soit par vidéo soit par photos a intervalles de temps régulier en plaçant une grille sur la paroi de l'aquarium pour gagner en précision. Mais ça reste quand même imprécis tout ça .. si quelqu'un a une meilleur idée ?

_ Nous cherchons aussi des enzymes capable de dégrader des peptidoglycanes Eheh

Voilà voilà si vous avez des remarques, des critiques, n'hésitez pas elles sont les bienvenues !

Merci !
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[inviteabd566ec]

Bonjour,

pour l'aspect biologique et chimique, je ne suis pas compétent.
Pour ce qui est de la mesure du déplacement, je ne vois pas très bien à quoi sert la grille ? En plaçant un appareil photo sur pied, vous pouvez avoir une résolution au pixel de la position, voir en dessous si vous considérez que vos bactéries sont indéformables (généralement à peu près vrai). L'appareil photo donne d'ailleurs probablement une meilleur précision spatiale qu'une caméra (mais moins bonne résolution temporelle). Après il faudrait quelques précisions sur le montage que vous avez : une seule bactérie ou plusieurs suivies, sous microscope / objectif macro / objectif classique (du coup quelle est la taille typique des bactéries / de la colonie et sa vitesse de déplacement typique) etc.
De plus, ne pas oublier pour la mesure de déplacement de petits objets la grande efficacité du couplage laser / photodiode 2 ou 4 cadrans (utilisé pour les montages de type pinces optiques par exemple).

[invite11356b32]

Merci d'avoir répondu
La grille aurait permis d'avoir une échelle pour faciliter les mesures.
En fait on va mesurer la vitesse de déplacement vertical d'une colonie de bactéries ( fleur d'eau ) mais on fera aussi des mesures de vitesse de déplacement sur une cyanobactérie sous microscope optique.
Qu'est ce que c'est exactement le couplage laser/ photodiode ?

[invite32f57b05]

ambitieux et original.

Vous n'avez pas besoin d'une grille : il vous suffit d'avoir un dispositif fixe le temps des suivis, et de prendre des photos.
Vous aurez déjà une grille très fine ; celle de la plaque CCD.

Vous pouvez analyser ce genre de photos sous Matlab.
N'hésitez pas à me contacter pour ça une fois que vous en aurez.

[A voir en vidéo sur Futura]