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MOIs - Petit problème d'analyse d'article



  1. #1
    Dizaall

    Question MOIs - Petit problème d'analyse d'article


    ------

    Bonjour à tous,

    J'ai un petit problème concernant l'analyse d'un article traitant des RNAi.
    (short hairpin RNA-expressing bacteria elicit RNA interference in mammals, S. Xiang, Nature Biotechnology, vol 24, no 6, 697-702 (2006) )


    En fait, pour résumer, les auteurs ont infecté des cellules humaines avec des E.coli possédant un plasmide TRIP sur lequel on retrouve une partie codant pour un short hairpin RNA dirigée contre CTNNB1.

    Ils observent ensuite l'effet de cette infection sur l'expression du gène et notent un "gene silencing".
    Voici les résultats que je ne comprends pas bien. fig 1c ligne 4-7:


    Il semble que le gène soit plus éteint pour un MOI de 1:1000 que pour un MOI de 1:100.
    Je ne comprends pas vraiment pourquoi.
    Dans mon esprit, plus il y a de particules infectieuses par cellules, plus le gène peut être atteint, non?

    D'autre part, je ne comprends pas bien le 1:500 au dessus, juste sous la construction plasmidique utilisée.


    J'espère que vous pourrez m'aider parce que là, plus j'y pense et plus je m'embrouille.


    Merci d'avance

    -----

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  3. #2
    Dizaall

    Re : MOIs - Petit problème d'analyse d'article

    Mince, personne ne sait m'aider ?


    C'est peut-être tout bête, juste un truc auquel je n'aurais pas pensé, mais je ne vois vraiment pas.

  4. #3
    malesore

    Re : MOIs - Petit problème d'analyse d'article

    Bonjour à toi,

    Je vais essayer de lire la publi et je te tiens au courant

  5. #4
    Elendilmir

    Re : MOIs - Petit problème d'analyse d'article

    Bon j'ai regardé le truc un peu en biais, mais il y a un truc bizarre...
    Je fais de la viro, et on parle de 5000MOI ou de 100MOI par exemple, cad 5000 particules ou 100 particules par cellule...

    Ici le 1:100 ou 1:500 est écrit bizarrement, on dirait presque une dilution...
    Ils disent dans l'énoncé concernant les deux contrôles lignes 2-3 que même à haut MOI (1:5000), il n'y a pas de diminution, donc pour moi, il semble que 1:1000 soit 1000MOI et 1:100 100MOI, donc avec un effet atténuant plus important avec 1000MOI que 100MOI ce qui correspond à ce que tu attendais...
    Est ce que le problème se situait là?

    Quand au 1:500 du plasmide, aucune idée, faudrait voir peut être dans le matériel/méthode...
    Qui s'assied au fond d'un puits pour contempler le ciel le trouvera petit.

  6. A voir en vidéo sur Futura
  7. #5
    malesore

    Re : MOIs - Petit problème d'analyse d'article

    Je viens de lire la publi, et effectivemet 1:100 ou 1:1000 ... correspond à 100MOI ou 1000MOI d'où le silencing qu'on observe à 1:1000MOI.
    Le 1:500 au dessus correspond au MOI utilisé pour le ShRNA et la partie hly-inv du plasmide.
    ILs ont constaté dans la meme figure qu'a 1:5000MOi de SHRNA ou de hly-inv, il n'y a pas de silencing, donc ils ont utilisé un MOI quelconque puisqu'il n'y a pas de silencing à 5000MOI.

    Voila ce que j'ai compris

  8. #6
    Dizaall

    Re : MOIs - Petit problème d'analyse d'article

    Roooh, merci beaucoup !!!


    C'est vraiment sympa d'avoir regardé ça pour moi !
    Je travaille pas trop dans le domaine alors les MOIs et tous ces trucs là je connais pas trop.


    Quelle idée d'aller mettre 1:5000 pour un MOI de 5000


    Là maintenant c'est limpide. Merci beaucoup.





    En fait, j'osais pas l'avouer, mais c'est pour demain.
    Vous me sauvez vraiment sur ce coup parce que présenter qq chose qu'on ne maitrise pas, c'est pas top pour être convaincant.

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