Bonjour à tous,
je ne sais pas trop si je suis dans le bon forum...
J'ai un problème de traduction d'une phrase dans une publication. La voici:
"The efficacy of gene silencing in plants using inverted-repeat transgene constructs encoding hairpin RNA has been demonstrated".
C'est le terme inverted-repeat qui me pose problème, je ne sais pas à quoi ca correspond.
Merci de votre aide
inverted repeat est tout simplement une séquence d'ADN présentant deux domaines inversés l'un par rapport à l'autre : AAGCCT____TCCGAA. Dans le cas des récepteurs nucléaires, on a parfois des éléments de réponse sur des promoteurs qui sont soit des direct repeat, dans le même ordre, ou des inverted repeat, inversés comme dans mon exemple.
EDIT : Par contre, dans ton cas, c'est un shRNA, donc c'est complémentaire : AAGCCT____AGGCTT, tu comprend? Ca s'hybride sur lui même en fait en laissant une boucle d'où le terme hairpin (épingle à cheveux)
Greg
non je n'ai pas très bien compris...
si le hpRNA a des séquences complémentaires, elles ne peuvent pas être inversées en même temps...
bein si c'est inversé, pour que ce soit "hybridable" lorsque la séquence se replie sur elle-même, il faut obligatoirement que ce soit inversé. Exemple, tu prend une feuille de papier et tu trace des traits de couleurs de cette façon : vert-rouge, un espace blanc, rouge-vert (donc inversé). Quand tu replieras ta feuille, le rouge ira sur le rouge, le vert sur le vert, c'est une question de logique. Ici vu qu'on parle d'ADN, il faut que ce soit inversé, mais en plus complémentaire.
AAGTCC-espace-GGACTT. Quand tu replie, chaque base du deuxième domaine se case en face de sa base complémentaire sur le premier domaine. Je peux pas simplifier plus.
PS : c'est shRNA (pour short hairpin RNA)...
Greg
en fait ce qui me gênait c'est ta première phrase: AAGCCT____TCCGAA ne peut pas se replier et s'hybrider. Mais sinon ca va j'ai compris, je te remercie beaucoup pour ton aide.
Bonne soirée
ps: dans ma publi sortie de nature biotechnology, ils parlent bien de hpRNA
