Quantification relative en qPCR

[invite21e02b96]

Bonsoir,
Je mène en ce moment des expériences de qPCR visant à quantifier l'expression de quelques gènes par rapport à un gène de ménage suite à une transfection.
J'ai après récupération des résultats, utilisé l'équation de Pfaffl pour établir les ratio d'expression relative. J'obtiens des valeurs inférieures à 1 si le gène est sous exprimé et supérieures à 1 dans le cas contraire.
Cependant une fois ce ratio obtenu je peine un peu pour savoir qu'en faire? Dois-je en faire un pourcentage ? Comment faire une représentation efficace ? sous quelle forme ?
Comment caluculer les barres d'erreur ?
Voilà merci de me répondre, je peine un peu avec la bibliographie :s les auteurs expliquent rarement comment ils ont établi leur résultats!

Merci!
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[TanguyE]

Bonsoir,

Pour la représentation, c'est comme vous le sentez en fait, je ne crois pas qu'il y ai de normes. Mais c'est vrai que le plus parlant reste un histogramme avec des barres d'erreurs. Faire de ce ratio un pourcentage me parait une bonne chose également, c'est généralement plus simple à dire "ce gène est sous exprimé d'environ 20% dans la condition A" que de parler d'un ratio de 0,8.

Pour ce qui est des barres d'erreur, elles ne sont réalisables que si vous avez plusieurs jeux de données sur la même manip dans les mêmes conditions ce qui permet de calculer un écart-type et donc d'intégrer des barres d'erreur à votre graphique.

Cordialement