La cellule mystère....

[chris2003]

Bonjour a vous, quelle bonne idée de jeu, je m'incruste et attend avec impatience la prochaine colle !
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[invite563835f6]

J'ai eu de la chance, je venais d'en apprendre quelques une, dont CENPA.

Bon, à moi. A vous de jouer. (désolé pour le retard)

[chris2003]

C'est pas évident ^^

Je vois absolument pas à quoi ça correspond

[invite563835f6]

J'ai oublié de dire ce que j'attendais; donc il me faut:
- la technique utilisée
- ce qui est représenté
- le rôle de ce qui est représenté

Bien sûr, il vous faudra des indices pour déduire ce dont il s agit mais j'attends que vous vous approchiez un peu d'abord.

[chris2003]

Dejà serait-ce un caméra thermique ?

[Flyingbike]

En bas ca ressemble a une représentation de FRET. On étudie des interactions protéiques en mouvement par photobleaching (FRAP) ?

C'est du confocal ?

[invite563835f6]

c'est bien une technique de FRAP qui est employée ici.
qu'est ce qui est fluorescent à votre avis ?

[chris2003]

Ca ressemble à un chromosome (ok je suis pas allé cherché bien loin mais bon )

[LXR]

En bleu je dirais que c'est le noyau (pas pris trop de risque sur ce coup là mais qui sais...?).

En vert, cela est localisé à la surface du noyau (si c'en est un), de taille conséquente, provoquant une légère protrusion, et de structure conique (panier de basket) ce qui me fait penser à un pore nucléaire....Cependant ce qui me fait revoir cette supposition à la baisse c'est son importante grosseur par rapport au noyau et la présence d'une seule structure de ce type...

Greg

[invite563835f6]

En bleu je dirais que c'est le noyau (pas pris trop de risque sur ce coup là mais qui sais...?).

En vert, cela est localisé à la surface du noyau (si c'en est un), de taille conséquente, provoquant une légère protrusion, et de structure conique (panier de basket) ce qui me fait penser à un pore nucléaire....Cependant ce qui me fait revoir cette supposition à la baisse c'est son importante grosseur par rapport au noyau et la présence d'une seule structure de ce type...

Greg

Il s'agit bien d'un composant nucléaire qui est fluorescent, mais pas un pore désolé...

[chris2003]

s'agirait t'il d'hétérochromatine ? c'est en périphérie du noyau et ca peut prendre cette forme, ce qui me dérange c'est que c'est bien localisé et qu'il n'y en a pas ailleurs en périphérie.

[nowell]

On doit trouver une cellule au finale ou un composant cellulaire ?

Je vais malgré tout tenter de faire avancer le Schmilblick.
Le photobleaching témoigne déjà d'une mobilité du bin's. Bon sang c'est hardos.
Des arn particuliers ? ou encore des sites de transcription à haute fréquence ?

[inviteee9cffed]

Bonjour, moi je pense qu'il n'y a qu'une couleur et que le bleu représente une faible intensité de fluo. La prot à trouver est alors présente dans une grande partie du noyau, à certain endroits de façon trés dense et à d'autre presque absente. Vu la cinétique de récupération de fluo je ne pense pas qu'il s'agisse d'histones qui était ma premiere idée. Mais la je sèche, je n'ai pas trop d'idées.

[Flyingbike]

Bonjour, moi je pense qu'il n'y a qu'une couleur et que le bleu représente une faible intensité de fluo. La prot à trouver est alors présente dans une grande partie du noyau, à certain endroits de façon trés dense et à d'autre presque absente. Vu la cinétique de récupération de fluo je ne pense pas qu'il s'agisse d'histones qui était ma premiere idée. Mais la je sèche, je n'ai pas trop d'idées.

bensouk ton pseudo me dit quelque chose
tu ne bosse pas au CEA par exemple ?

[inviteee9cffed]

bensouk ton pseudo me dit quelque chose
tu ne bosse pas au CEA par exemple ?

Mais qui peux-tu bien être?

[Flyingbike]

je t'ai supporté en M1 mais je n'ai pas les cheveux longs

[inviteee9cffed]

Trouvé! Mais ça ne répond pas à la question pour cette cellule

[Jean-Luc P]

l'actine G ? Puisqu'elle est présente dans le noyau...

[Flyingbike]

deja est-ce du FRET en bas ? on utilise souvent cette représentation rainbow pour le Fret...

[Zellus]

Salut,

Je suis tombé complètement par hasard sur des documents qui ressemblaient à ça l'autre jour. Alors j'aurais envie de dire que c'est la fibrillarine qu'on voit et qui participe il me semble à la reconstitution du nucléole après la mitose. C'est ça ?

[invite563835f6]

Bonjour, moi je pense qu'il n'y a qu'une couleur et que le bleu représente une faible intensité de fluo. La prot à trouver est alors présente dans une grande partie du noyau, à certain endroits de façon trés dense et à d'autre presque absente. Vu la cinétique de récupération de fluo je ne pense pas qu'il s'agisse d'histones qui était ma premiere idée. Mais la je sèche, je n'ai pas trop d'idées.

Tu es très proche... désolé si c'est un peu hardos et que je suis radin sur les indices, mais j'ai l'impression que vous n'avez pas besoin de moi pour vous rapprocher de la cible.

Donc en résumé, c'est bien dans le noyau, c'est bien une faible intensité de fluorescence en bleu, la protéine est donc présente dans des zones très ciblées du noyau et +/- absentes dans les autres zones....
Il ne s'agit pas d'une histone, mais c'est en rapport

[Jean-Luc P]

Histone désacétylase ?

[inviteb94d8e21]

La cinétique (rapide) de "recovery" et la localisation périnucléaire pourraient coller avec une des isoformes de HP1, mais, en général, les patches de HP1 sont plus nombreux.

Ca dépend peut-être du type cellulaire...

[inviteee9cffed]

Histone désacétylase ?

Je penche aussi pour des prot de remodelage de l'ADN (DMNT, HDAC ou HAC), mais laquelle?

[inviteee9cffed]

Et est ce que trouver cette prot va nous permettre de trouver le type cellulaire?

[LXR]

Cela est-il en lien avec les LCR (la localisation en périphérie du noyau m'oriente vers cette hypothèse...)?

Greg

[invite563835f6]

Je reprends chacun de vos posts.
Jean Luc P => non il ne s'agit pas d'une histone désacétylase
Bensouk => tu touches de très près la réponse, mais la présence de la protéine en question est indépendante du tissu (en tout cas je ne vois pas quel tissu en aurait plus)
LXR => si je me souviens bien les séquences LCR attirent les complexes de remodelage, donc je dirais pourquoi pas, même si je ne peux pas te dire un oui définitif

Kucing => tu as tout à fait raison, le marquage porte bien sur HP1.

Voilà, je vous précise un peu l'intérêt de cette photo:
On a réalisé une expérience de FRAP avec une fusion GFP-HP1 pour étudier la mobilité de cette protéine sur l'hétérochromatine.
Si Hp1 est très peu mobile, et qu’une fois qu’elle s’est liée à l’hétérochromatine, elle y reste, alors on observerait pas de retour de la fluorescence. En réalité on obtient un retour de la fluorescence => échange de HP1 entre la zone blanchie par le laser et les autres HP1 présentes dans le noyau.

Quel est le rôle de HP1 maintenant ?
HP1 est une protéine qui se trouve préférentiellement au niveau de l'hétérochromatine et qui se fixe sur les mH3K9 grâce à son "chromodomaine". Une fois fixée, elle recrute une autre protéine (Suv39h) qui est une histone méthyltransférase. La méthylation du résidu K9 de l'histone H3 va attirer de nouveau HP1 qui va attirer de nouveau Suv39h etc.
=> On aura ainsi une hétérochromatinisation de la chromatine.
Ce genre de mécanisme permet donc l'auto-entretient de l'hétérochromatine.

Bravo donc à Kucing, à toi.

[inviteb94d8e21]

Ah, bon, c'est encore moi qui m'y colle... OK:

Kézako ?



Un indice : ce n'est pas une histoire de chromatine cette fois.
Un deuxième indice : les trucs verts et les trucs jaunes sont la même chose, juste l'intensité du marquage qui varie.

Dites moi :
1/ De quel type de cellule s'agit-il ?
2/ Qu'est ce qui est marqué en rouge (la structure, pas la molécule)?
3/ Qu'est-ce qui est marqué en vert ou en jaune (idem, la structure, pas la molécule)?
4/ Quelle est la technique de microscopie qui donne de belles images comme celle là ?

Ca ne devrait pas être trop difficile.

[invite563835f6]

Des loges polliniques en rouge avec des grains de pollen dont la sporopollenine est marquée en vert ou jaune
la technique ? MEB ?

[Flyingbike]

ah non si c'est du végétal je démissionne !