Exercice sur les complexes récepteur/métal

[invite9dcd1b0d]

Bonjour, je bloque sur la première question de cet exercice, quelqu'un pourrait-il m'aider svp?

Le récepteur suivant est capable d'extraire des bases nucléiques dans l'acétone. Ce récepteur est sélectif pour la guanine. Ce récepteur est sélectif pour la guanine.

1- donner les 3 différents sites de chélation et le type d’interaction pour chaque site.
2- quels sont les différents effets à prendre en compte pour ce récepteur?
3- quel est le rôle du métal?
4- justifier le fait que les ligands du palladium sont des souffres.
5- un analogue ne possédant pas les cycles aromatiques n'a qu'une très faible affinité pour la guanine. expliquer cette observation.
6- représenter la guanine dans le récepteur et les différentes interactions qui le maintiennent en place.




Merci.
-----

[invite9dcd1b0d]

Pour la question 1) je pensais à la partie podante du récepteur, qui ferait des liaisons hydrogènes avec la guanine, et aux phényl qui feraient des intéractions pi-dipôle ou pi-anion je ne sais pas...

[CN_is_Chuck_Norris]

Bonjour,
et tu as proposé quoi?
As-tu eu un cours sur les interactions supramoléculaires?
Il faut prendre en compte toute les liaisons de nature non-covalente (incluant celle de coordination qui malheureusement s'appelle maintenant "covalente de coordination"...)

[CN_is_Chuck_Norris]

Pour la question 1) je pensais à la partie podante du récepteur, qui ferait des liaisons hydrogènes avec la guanine, et aux phényl qui feraient des intéractions pi-dipôle ou pi-anion je ne sais pas...

Oui, il y aura du π-stacking. (ce qui est confirmer par la question 5)
ça sent aussi la liaison hydrogène à plein nez entre la fonction guanidine et la partie polyéthylene glycol.

Par ailleurs, il y a un souci avec le Palladium, la comme ça, c'est un Pd(I) qui n'existe pas! y aurait-il une charge + sur le recepteur?
ton centre métallique sert à au moins 2 choses: 1) maintenir en place un bon agencement du recepteur. 2) liaison de coordination...?

[A voir en vidéo sur Futura]

[invite9dcd1b0d]

Non il n'y a pas de charge + sur le récepteur...
et donc d'après ce que vous me dites, le palladium serait un site de chelation et ferait une liaison de coordination avec la guanine?
J'ai eu un cours mais très court sur ce chapitre, et je ne comprends même pas comment le récepteur peut lier un métal ET la guanine, je pensais que l'on avait seulement des complexes récepteur/métal ou ligand/métal...

[invite9dcd1b0d]

Et le π-stacking ce n'est pas des interactions entre 2 groupements phényl? Il ne va donc pas y avoir d'interaction entre les groupements phényl et la guanine?

[CN_is_Chuck_Norris]

Oui, tu vas avoir un interaction Pd-guanine (genre avec le N7 ou le N9 ce qui sera spatialement le plus favorable).

3 interactions:
-Stacking
-Liaisons H
-Liaisons de coordinations (Pd-N)

Mais cet atome de Pd me chiffonne. J'ai pas souvenir d'avoir vu beaucoup de Pd(I)
Généralement, il aime pas avoir de site de coordination vacant comme c'est le cas ici. Dans ces conditions des interactions agostiques ou avec le solvant se produisent souvent.
Mais, on pourrait voir ça aussi en pensant qu'une plus forte coordination (Pd-N) aura lieu afin de stabiliser ton centre métallique.

[CN_is_Chuck_Norris]

Et le π-stacking ce n'est pas des interactions entre 2 groupements phényl? Il ne va donc pas y avoir d'interaction entre les groupements phényl et la guanine?

Si.
la guanine, va s'intercaler entre les cycles et ainsi maximiser le stacking.

[invite9dcd1b0d]

Ok merci et du coup le Pd a pour rôle de stabiliser encore plus le complexe avec la guanine en faisant une liaison de coordination?

[CN_is_Chuck_Norris]

oui, c'est ça.

[invite9dcd1b0d]

Merci beaucoup pour vos réponses, je comprends mieux maintenant.
En ce qui concerne la représentation de la guanine dans le récepteur, je ne sais pas comment m'y prendre... avec quels azotes va-t-il y avoir des liaisons H?

[CN_is_Chuck_Norris]

Je dirai que le NH2 de la guanidine sera vers le polyether.
Un N du cycle imidazole sera coordiné au palladium.
un truc dans le genre.