Bonjour,
J'essaie de me documenter sur les enzymes (structures d'acides aminés).
Savez-vous si certaines enzymes sont suffisamment bien connues pour que l'on en connaisse la structure exacte ?
Savez-vous s'il existe un organisme international chargé de répertorier les enzymes connues ?
Merci pour vos réponses.
Acetate92
Bien sûr ! On connaît la structure exacte d'un grand nombre d'enzymes.
Tu peux taper "enzyme database" ou "protein database" sur google et tu trouveras des informations sur ce genre de site : http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do
Bonjour,
Merci pour la réponse !
Je suis allé sur le lien et en fouillant un peu, je suis parvenu sur le site http://www.uniprot.org (super top !).
Lorsque les spécialistes de la biochimie macromléculaire réussisent à assembler autant d'acides aminés (apparamment souvent 500-700 à la suite) dans le but d'obtenir des enzymes, est-ce que l'enzyme créée prend spontanément sa conformation géométrique ?
Acetate92
En fait les enzymes sont purifiés à partir d'échantillons biologiques. Il n'est pas possible de synthétiser des protéines aussi grosses !
C'est une peu ce que je pensais aussi.
Je suppose que la chaine d'AA peut sans doute se casser lors de la fabrication et que les proteines sont si longues qu'elles peuvent s'emméler.
Ce sont les rendements et les différents groupements protecteurs qui limitent la synthèse. Imagine si tu as un rendement d'incorporation de chaque acide aminé de 99% (ce qui est excellent), au bout de 100 acides aminés tu n'auras que 37% du peptide complet. A 95% de rendement par incorporation, tu n'auras plus que 0.6% ! Et après il faut déprotéger les fonctions latérales des acides aminés et purifier ton peptide !
Merci pour cette précision interessante.
Vu comme ça, en effet, je comprends mieux ce qui bloque !
sans parler du repliement qui doit être correct
il y a des enzymes dont c'est le boulot : chaperones
sans parler des éventuelles glycosylations et autres phosphorylations
cordialement
