Géométrie des molécules
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Géométrie des molécules



  1. #1
    rrricharddd

    Géométrie des molécules


    ------

    Bonjour,

    Souvent dans les exercices de nomenclature, les formules semi-développée des alcanes sont telles que les atomes sont disposés de manière a former des parties d'hexagones.
    Je suppose que cela est du à la géométrie des alcanes. Mais comment savoir de quelle manière représenter les autres molécules ?

    -----

  2. #2
    moco

    Re : Géométrie des molécules

    Bonjour,
    Qu'est-ce que tu appelles des "parties d'hexagone" ?
    Et qu'est-ce que tu appelles les "autres molécules" ? A part les alcanes, il existe des millions d'autres molécules. Desquelles veux-tu parler ?

  3. #3
    rrricharddd

    Re : Géométrie des molécules

    Pour le coup c'est un aldéhyde mais voilà ce que j’entends par "partie d'hexagone":

    Nom : aaa.png
Affichages : 135
Taille : 2,2 Ko

    Et pour les molécules dont je veux parler c'est justement toute les molécules.

  4. #4
    Kemiste
    Responsable technique

    Re : Géométrie des molécules

    Bonjour.

    La représentation que tu donnes n'est qu'une représentation parmi tant d'autres. N'oublie pas qu'au niveau d'une liaison simple il y a une libre rotation. Tu aurais pu mettre l’aldéhyde "en haut", le C=O dirigé vers la gauche... ça n'aurait rien changé. On représente souvent les molécules de telle façon à ce que ça ne fasse pas trop "désordre" (une chaîne repliée où les groupements se superposent...).
    Dernière modification par Kemiste ; 29/05/2016 à 13h45.

  5. A voir en vidéo sur Futura
  6. #5
    rrricharddd

    Re : Géométrie des molécules

    Merci de vos réponses,

    Pour le cas des représentations en 3 dimensions de ce type:

    Nom : Isopentane-numbered-3D-balls.png
Affichages : 145
Taille : 57,0 Ko

    Le fait que les atomes soient disposés aussi en hexagone, est-ce là aussi pour ne pas faire désordre, ou est-ce parce que bien qu'il y ai des rotations entre les liaisons simples, les molécules ont tendance à rester plus dans une position que dans une autre?

  7. #6
    Kemiste
    Responsable technique

    Re : Géométrie des molécules

    Je ne vois pas trop où est l'hexagone...

    Dans ce type de représentation, il faut respecter les angles entre les atomes (ici pour les C on a des angles d'environ 109°). Quand un carbone forme quatre liaisons il a une géométrie tétraédrique. Comme dans le cas précédent, ce n'est qu'une représentation parmi tant d'autres. Le groupe "4" aurait pu être "en bas", "devant", "derrière"... étant donné qu'il n'y a que des liaisons simples.

    Toutes les représentations de ces molécules qui ne sont issus que de rotation autours d'une liaison simple sont appelés conformères. Ce sont les représentations dans l'espace d'une même molécule. Certains représentation ont moins de poids que d'autres. Plus il y a d'encombrement moins la molécule adoptera la conformation. Une chaîne repliée sur elle même avec des groupement proche sera moins favorable qu'une chaîne où les groupements sont les plus éloignés les uns des autres.
    Dernière modification par Kemiste ; 29/05/2016 à 14h27.

  8. #7
    rrricharddd

    Re : Géométrie des molécules

    Citation Envoyé par Kemiste Voir le message
    Je ne vois pas trop où est l'hexagone...

    Dans ce type de représentation, il faut respecter les angles entre les atomes (ici pour les C on a des angles d'environ 109°)
    A l’œil nu il est dur de faire la différence entre 109° et 120°

    Citation Envoyé par Kemiste Voir le message
    Plus il y a d'encombrement moins la molécule adoptera la conformation. Une chaîne repliée sur elle même avec des groupement proche sera moins favorable qu'une chaîne où les groupements sont les plus éloignés les uns des autres.
    Je pensais enfaite que les molécules avaient tendance à adopter ce genre de disposition (repliées sur elles-même) à cause des doublets non liant qui repoussent les autres atomes comme pour la molécule d'eau, les atomes d’hydrogène ont moins tendance à être écartés au maximum que de former un coude avec l’oxygène

    Merci encore pour vos réponses

  9. #8
    Kemiste
    Responsable technique

    Re : Géométrie des molécules

    Citation Envoyé par rrricharddd Voir le message
    A l’œil nu il est dur de faire la différence entre 109° et 120°
    C'est le problème de faire une représentation 3D sur un support 2D.

    Citation Envoyé par rrricharddd Voir le message
    Je pensais enfaite que les molécules avaient tendance à adopter ce genre de disposition (repliées sur elles-même) à cause des doublets non liant qui repoussent les autres atomes comme pour la molécule d'eau, les atomes d’hydrogène ont moins tendance à être écartés au maximum que de former un coude avec l’oxygène
    Je parlais à l'échelle globale de la molécule. Pour un atome donné il faut regarder son environnement.

    Pour le carbone, ici, il y a 4 liaisons. La meilleure façon de limiter les interactions entre les électrons est d'adopter une géométrie tétraédrique. Pour l'eau ce n'est pas pareil. L'atome d'oxygène forme deux liaisons mais porte deux doublets non liants. Ce sont ces derniers qui vont expliquer que la molécule est coudée. Pour plus de détails, voir la méthode VSEPR.

  10. #9
    rrricharddd

    Re : Géométrie des molécules

    Merci beaucoup

    Une dernière question, est-ce stupide de chercher à dessiner les formules semi-développées de manière à rendre compte de l'allure qu'à le plus souvent tendance à avoir la molécule ?

  11. #10
    Kemiste
    Responsable technique

    Re : Géométrie des molécules

    Ce n'est pas stupide mais est-ce toujours utile ?

    Il ne faut pas oublier que ce n'est qu'une représentation sur papier. Une représentation n'est pas plus fausse qu'une autre. Il n'est pas toujours simple de trouver la conformation de plus basse énergie. Cela demande de nombreux calculs qui sont réalisés informatiquement. Il ne faut pas oublier non plus que dans la "réalité" la molécule adopte de très nombreuses conformations dû aux nombreuses rotations autours des liaisons simples.
    Dernière modification par Kemiste ; 29/05/2016 à 16h02.

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