Non, ce n'est pas la bonne régle : c'est la régle classique acido-basique
pH<pKa : forme acide ; pH>pKa : forme basique
Tant qu'on ne connait pas le groupement correspondant, on ne peut conclure en ce qui concerne les charges.
Sinon, voir éventuellement : p1.asso2atp.fr
D’accord j’ai déjà consulté ce document mais ça ne m’aide pas vraiment, pouvez vous me faire un exemple pour que je comprenne mieux
Cystèine de bout pKa (COOH/COO-)=1,7 : si pH<1,7 neutre (COOH) si pH>1,7 - (COO-) pKr(SH/H) même chose avec pKr=10,8 (NH2 pris dans la liaison peptidique)
Glycine de bout pKa(NH3+/NH2)=9,6 : si pH<9,6 + si pH>9,6 neutre (COOH pris dans la liaison peptidique)
Tyrosine interne pKr(OH/O-) comme cystéine
Je ne comprends pas pour les internes
Que ne comprenez-vous pas ? C'est toujours la même règle pH<pKa forme acide, pH>pKa forme basique, il faut donc écrire le couple et regarder les charges.
Donc pour la tyrosine ph<pka donc forme acide (OH/O-) donc charge - c’est ça ?
Charge + pardon
Pour l’idoleucine pas de pkr donc je ne mets pas de charge
Je trouve alors charge nette +2
pH<pKa donc forme acide donc OH, donc neutre et je ne vois surtout pas comment cela pourrait donner +Envoyé par Lisou30640
D’accord compris ainsi pour l’isoleucine, glutamine,asparagine,cysteine, prolonge,leucine tout est neutre
La charge nette sera égale à 0
c'est bien cela.
D’accord pour pH 7,4 je trouve aussi 0
Pour le pH 9 je trouve -3
pH=7,4 OK
pH=9 je trouve -2 (les deux pKr des cystèines)
Ah oui la tyrosine est de charge +
Ah non neutre pardon
Re Bonjour si je prends la même molécule et qu’on me dit qu’il y a un pont disulfure entre les deux Cys que dois je faire ?
Cela annule bien sûr les propriétés acido-basiques (le pKr) puisque le -SH n'est plus là.
Comment dois procéder ?
Procéder pour faire quoi ? Je ne comprends pas la question.
Si j’annule les propriétés acido-basique (pkr) je ne prends plus en compte le pkr pour tous les acides aminées présents entre les 2 cysteines y compris les cysteines ?
La liaison -S-S- annule les propriétés acido-basique liées au pKr (-SH a disparu) des 2 cystéines.
Pourquoi est-ce que cela agirait sur les autres groupes acido-basiques ?
D’accord alors rien ne change
Il y a tout de même la perte des deux fonctions -SH des cystéines (et l'acidité qui les accompagne).
En prenant compte de ça je retrouve les mêmes charges pour les 3 ph
C'est ça. Une charge + et une -, en bouts de chaînes, qui se compensent.
A noter que, vu qu'on est à pH proche des pKa (pour pH 2 et 9), on va dire que la forme est majoritairement neutre. Mais les formes chargées deviennent, à ces pH, présentes en quantité significative ; alors qu'à pH 7,4 ça n'est pas le cas.
