[Stat] Khi² approprié ?

[blisax]

Bonjour,

J'ai une question sur le type de test statistique que je dois utiliser.
Je regarde des cellules au microscope et mesure la dynamique de particules intracellulaires. La dynamique d'une particule peut-être de trois types: A, B ou C. Pour chaque cellule j'ai donc une fréquence (car le nombre absolue n'est pertinent) de particules de type A, B ou C. J'ai fais ces mesures sur plusieurs cellules et j'ai aussi plusieurs condition. En résumé j'ai un plusieurs fréquences par condition. J'aimerais savoir si les fréquences mesurées sont indépendantes de la condition. A priori cela ressemble a une situation où le khi² est tout indiqué MAIS la différence c'est que j'ai plusieurs fréquences par condition et non pas une fréquence total ! Je peux bien retrouver un "count" total mais ça serait considérer que mon unité statistique est la particule alors que c'est clairement la cellule... Finalement puisque j'ai des fréquences moyennes par condition, je suis plutôt tenté d'utiliser un test de Student mais le fait d'avoir des données bornées me gène un peu. Quel test me recommandez vous ?

Merci d'avance,
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[gg0]

Bonjour.

Le fait d'avoir des fréquences bloque l'utilisation d'un khi-deux (qui nécessite des effectifs, ou des fréquences d'un effectif total connu). de plus, si j'ai bien compris, les fréquences ne sont pas indépendantes (pour une seule cellule, leur somme est 100%). Donc il sera difficile d'utiliser un test de comparaison d'échantillons. On peut éventuellement se débarrasser du problème en n'analysant que deux fréquences. Dans ce cas, mais sous toutes réserves (je ne connais pas les données), on peut penser à une anova. La non Normalité des données ne pose généralement pas de problème.
Mais si c'est un travail scientifique, le mieux est de te mettre en rapport avec un biostatisticien, qui pourra proposer des pistes et valider ton analyse (et cosigner un éventuel article).

Cordialement.

[blisax]

Bonjour,

Merci pour votre réponse, comme je le pensais le problème est pas si facile...
Effectivement c'est pour un travail scientifique et effectivement les fréquences ne sont pas indépendantes.
Reste encore la possibilité d'un test de permutation qui demande un peu de code mais permets d'évacuer les problèmes soulevés si je ne dis pas de bêtise ?