calcul de la charge nette d'un peptide

[eva08]

Bonjour
Je suis en première année de médecine, je bloque dans le calcul de la charge nette à pH 2 du peptide suivant : M-K-Y-D-N
Je ne vois pas comment faire lorsque pKc est égale au pH
Merci d'avance
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[gts2]

Bonjour,

Lorsque pH=pKa, il y a autant d'acide que de base, , il reste à traduire en charge.

[eva08]

Bonjour
Je ne comprends pas comment utiliser cette formule si je ne connais pas les valeurs, puisqu'en épreuve il nous la donne pas forcément.
Mais s'il y a autant d'acide que de base, je peux supposer qu'on est à charge nulle ?
Donc pour ce peptide, j'ai
pKn = +1
lysine = +1
tyrosine = 0
aspartate = 0
pKc = 0

[gts2]

Je ne comprends pas comment utiliser cette formule si je ne connais pas les valeurs, puisqu'en épreuve il nous la donne pas forcément.

Si on ne vous donne pas les pKa ce n'est pas faisable, mais peut-être que les pKa ne varient pas trop et qu'on peut retenir une valeur moyenne. Le COOH est toujours (?) voisin de 2, le NH2 voisin de 9, par contre les chaines latérales c'est nettement plus variable et si on ne vous les donne pas, ce n'est pas faisable, d'autant plus que ce n'est pas toujours le même groupement..

Mais s'il y a autant d'acide que de base, je peux supposer qu'on est à charge nulle ?

Cela dépend du groupement : si pH=pKa ; si c'est COOH l'autre espèce c'est COO- donc 1/2(-) ; si c'est NH2, l'autre espèce c'est NH3+ et donc charge 1/2(+)

pKn = +1 ; lysine = +1 ; tyrosine = 0 ; aspartate = 0 ;pKc = 0

Je suppose que pKn=+1 n'est pas le pKa mais la charge terminale (pb de notation ?) et donc pKc =-1/2 en supposant toujours que pKc désigne la charge.

[A voir en vidéo sur Futura]