07/05/2003, 18h16
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#1 |
Date d'inscription: mai 2003 Localisation: Paris(92)
Messages: 1 031
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Je cherche des informations concernant l'ARN double-brins, sites internets, livres, etc..
Merci de vos réponses.
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@+ Sirius
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07/05/2003, 18h43
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#2 |
Date d'inscription: janvier 2003
Messages: 11 250
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Salut,
Ce sera avec plaisir que tu je te donnerais meme des informations personalisees si tu me dis ce que tu veux savoir sur l'ADN
Pour les sites je n'en n'ai pas comme ca, ca depends encore une fois surtout de quel genre d'info tu cherches.
Yoyo
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07/05/2003, 18h46
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#3 |
Date d'inscription: mai 2003 Localisation: Paris(92)
Messages: 1 031
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Je cherche surtout des infos sur l'interference à ARN.
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@+ Sirius
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07/05/2003, 18h55
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#4 |
Date d'inscription: janvier 2003
Messages: 11 250
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Salut,
oups j'avais mal lu  ops:
Pour le RNAi, ca pose pas trop de probleme non plus 
Tu cherches des ref bibliographiques (articles scientifiques?) ou le principe? les applications? etc...
Il y a eut cette news sur futura il y a quelques temps : L'ARNi utilise en therapie
Yoyo
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07/05/2003, 18h57
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#5 |
Date d'inscription: mai 2003 Localisation: Paris(92)
Messages: 1 031
| Citation: |
Tu cherches des ref bibliographiques (articles scientifiques?) ou le principe? les applications? etc...
| Surtout des infos sur le principe.
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@+ Sirius
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07/05/2003, 19h04
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#6 |
Date d'inscription: janvier 2003 Localisation: On the move...
Messages: 470
| Citation: |
Envoyé par Sirius Je cherche surtout des infos sur l'interference à ARN. | Une revue recente est parue dans Nature (Hanon, 2002, vol 418, p244).
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07/05/2003, 22h05
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#7 |
Date d'inscription: janvier 2003
Messages: 11 250
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Salut,
Alors le principe est simple... mais tu as quel niveau pour savoir a quel point rentrer dans les details!
Le principe est d'exprimer un petit ARN complementaire a une portion d'un ARNm. Apres ce petit ARN va s'apparier avec la region de l'ARNm concernee. La il y a deux cas de figures: Le complexe d'ARN double brin est pris en charge par un complexe enzymatique qui va provoquer la degradation complete de l'ARNm.
Soit cet region va provoquer l'inihbition de la traduction, ce qui va revenir a inactiver le gene de maniere spécifique sans affecter les autres genes.
Yoyo
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07/05/2003, 22h09
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#8 |
Date d'inscription: mai 2003 Localisation: Paris(92)
Messages: 1 031
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Merci mais c'est un peu leger.
Quel est le role de la RNaseIII Dicer, de la proteine kinase PKR
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@+ Sirius
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07/05/2003, 22h21
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#9 |
Date d'inscription: janvier 2003
Messages: 11 250
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Ah oui en effet...
Bon
Dicer: Clive les ARN double brin de grande taille en petits fragments de 21-22nt qui sont ceux qui vont jouer le role d'inhibition ou de degradation de l'ARNm.
La PKR: est une proteine kinase ARN double brin dependante. En gros elle est activée lorsqu'un ARNdb rentre dans la cellule (ce mechanisme sert de protection contre les virus a ARN qui sont souvent ARN double brin). Une fois la PKR activée elle va phsophorylée le facteur de traduction eIF2 qui deviens inactif, ce qui bloque l'initiation de la traduction.
j'espere que ca t'ira
Yoyo
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07/05/2003, 22h29
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#10 |
Date d'inscription: mai 2003 Localisation: Paris(92)
Messages: 1 031
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Merci beaucoup c'est bien ce que j'avais compris.
Peux tu me dire ce que sont les IFN genes
Je pense qi'ils sont lés à la synthèse d'interferons mais je n'en suis pas sur.
De plus j'ai lu que le phénomène d'interference pouvait jouer un role dans la lutte contre les infections virales
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@+ Sirius
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07/05/2003, 22h36
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#11 |
Date d'inscription: janvier 2003 Localisation: On the move...
Messages: 470
| Citation: |
Envoyé par Sirius Merci mais c'est un peu leger.
Quel est le role de la RNaseIII Dicer, de la proteine kinase PKR  | Citation: |
Envoyé par Sirius Merci mais c'est un peu leger.
Quel est le role de la RNaseIII Dicer, de la proteine kinase PKR  | Dicer reconait l'ARN double brin et le clive en fragment d'environ 22 nucleotides. Ces fragments d'ARN vont etre reconnus par un autre complexe moleculaire, le RISC (RNA-induced silencing complex) qui lui est responsable de la degradation du messager. De ce que je crois savoir, PKR est une RNA-dependent kinase et un systeme de defense non specifique, c'est a dire que cette enzyme est responsable de l'arret de traduction general lorsque des ARN double brins sont presents ce qui a laisser croire que le gene silencing chez les mammiferes seraient impossibles.
L'une des grandes difference entre le gene silencing des invertebres et des mammiferes est son "amplification". Chez C.elegans par exemple, la presence d'une infime quantite de siRNA est suffisante pour eteindre le gene viser a tout l'organisme et de ce transmettre a la generation suivante. Ce systeme semble absent chez les mammiferes puisque le silencing n'est que transitoire et se perd rapidement.
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07/05/2003, 22h37
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#12 |
Date d'inscription: janvier 2003 Localisation: On the move...
Messages: 470
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J'ai ete double sur ce coup la!! |
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07/05/2003, 22h44
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#13 |
Date d'inscription: janvier 2003
Messages: 11 250
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salut,
IFN. Oui c'est en rapport avec l'interferon. en fait des etudes ont montrees que la voie d'inactivation des ARNm ciblés par les petits siRNA (22nt) etait indépendante de la voie de reponse de l'interferon qui inactive les genes de maniere non spécifique. cette voie est activée par las grands ARN double brin. Cette seconde voie (IFN) est donc activé par les ARN de taille sup a 30 nt et passe justement par l'activation de la proteine PKR. Elle est dite non specifique car la phosphorylation du facteur IF2alpha inhibe la traduction de maniere generale (non specifique d'un gene en particulier).
La voie de l'INF active aussi une autre enzyme (2'-5'-oligoadenylate synthetase) qui provoque la degradation des ARNm de maniere non specifique par l'intermediraire de la RNase L
POur les developpement therapeutique contre les virus, l'idee est de ciblee grace a ces petits ARN des sequences des ARN viraux afin de les inactives. Des resultats recents publies dans PNAS montrent par exemple qu'il est possible d'empecher la replication du virus de l'hepatite C de cette maniere.
(voir aussi la news de futura-sciences, citee plus haut).
Yoyo
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07/05/2003, 22h48
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#14 |
Date d'inscription: janvier 2003
Messages: 11 250
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Envoyé par Igothigh J'ai ete double sur ce coup la!!  | Desole Igothigh 
Mais au moins on ne se contredit pas c'est deja ca
Yoyo
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07/05/2003, 22h50
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#15 |
Date d'inscription: mai 2003 Localisation: Paris(92)
Messages: 1 031
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Merci encore pour ton aide.
J'ai plus de questions pour le moment, mais qui sait peut etre plus tard.
Tu bosses dessus pour en connaitre autant, ou c'est en tombant sur un article que tu t'y es interessé
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@+ Sirius
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07/05/2003, 22h55
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#16 |
Date d'inscription: janvier 2003
Messages: 11 250
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De rien 
Si tu as d'autres questions n'hesite pas. C'est en effet un sujet tres interessant.
Je travaille sur la traduction, et sur la structure des ARNm, donc c'est un domain tres proche du RNAi!
en plus l'ete dernier j'ai assiste a un seminaire d'un pris nobel de medecine sur le sujet et c'etait vraiment passionant
A+
Yoyo
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07/05/2003, 22h57
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#17 |
Date d'inscription: janvier 2003 Localisation: On the move...
Messages: 470
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Envoyé par Yoyo Mais au moins on ne se contredit pas c'est deja ca
Yoyo | Exact... meme si ca donnerait un peu de piment |
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07/05/2003, 23h24
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#18 |
Date d'inscription: janvier 2003 Localisation: On the move...
Messages: 470
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Moi, du coup, j'ai aussi une question.
Connait-on les determinants qui dirigent (s'il est dirige) le clivage par Dicer?
En fait, c'est purement pratique. Il semble que certains siRNA soient plus efficaces que d'autre (certains avancent une chance sur 4 de tomber sur le bon, ce qui est relativement faible) et donc se lancer dans ce genre de technique peut etre "time consuming". Y a t-il donc un moyen de determiner les regions de l'ARN les plus susceptibles d'avoir un effet suppresseur reel?
J'avais assiste a un seminaire ou une boite vendant des oligos avait developpe un logiciel pour determiner les sequences les plus susceptibles de fonctionner. Selon eux, leur prediction etait fiable a 95%. Seulement, c'etait une boite et pas moyen de connaitre les criteres de choix...
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